Skip to main content
Erschienen in: Archives of Virology 5/2013

01.05.2013 | Annotated Sequence Record

Complete genome sequence of the NVSL BoHV-1.1 Cooper reference strain

verfasst von: Jean M. d’Offay, Robert W. Fulton, R. Eberle

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 5/2013

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

The only complete genome sequence available for bovine herpesvirus 1 (BoHV-1) is a composite sequence derived from four different BoHV-1.1 strains and one BoHV-1.2 strain. Such a chimeric genome sequence is problematic for molecular genetic studies on this virus. We report here the complete genome sequence for the BoHV-1.1 NVSL reference strain Cooper. Although similar to the published chimeric genome sequence, there are a number of nucleotide substitutions and deletions/insertions across the genome, many of which affect coding sequences.
Literatur
1.
Zurück zum Zitat d’Offay JM, Mock RE, Fulton RW (1993) Isolation and characterization of encephalitic bovine herpesvirus type 1 isolates from cattle in North America. Am J Veterinary Res 54:534–539 d’Offay JM, Mock RE, Fulton RW (1993) Isolation and characterization of encephalitic bovine herpesvirus type 1 isolates from cattle in North America. Am J Veterinary Res 54:534–539
2.
Zurück zum Zitat Delhon G, Moraes MP, Lu Z, Afonso CL, Flores EF, Weiblen R, Kutish GF, Rock DL (2003) Genome of bovine herpesvirus 5. J Virol 77:10339–10347PubMedCrossRef Delhon G, Moraes MP, Lu Z, Afonso CL, Flores EF, Weiblen R, Kutish GF, Rock DL (2003) Genome of bovine herpesvirus 5. J Virol 77:10339–10347PubMedCrossRef
3.
Zurück zum Zitat Fulton RW (2009) Bovine respiratory disease research (1983–2009). Animal health research reviews/Conference of Research Workers in Animal Diseases 10:131–139 Fulton RW (2009) Bovine respiratory disease research (1983–2009). Animal health research reviews/Conference of Research Workers in Animal Diseases 10:131–139
4.
Zurück zum Zitat Fulton RW (2009) Viral diseases of bovine respiratory tract: bovine herpesvirus -1, parainfluenza-3 virus, bovine respiratory syncytial virus, bovine adenovirus, bovine coronavirus, and bovine viral diarrhea viruses. Elsevier, Philadelphia Fulton RW (2009) Viral diseases of bovine respiratory tract: bovine herpesvirus -1, parainfluenza-3 virus, bovine respiratory syncytial virus, bovine adenovirus, bovine coronavirus, and bovine viral diarrhea viruses. Elsevier, Philadelphia
5.
Zurück zum Zitat Khadr A, Tikoo SK, Babiuk LA, van Drunen Littel-van den Hurk S (1996) Sequence and expression of a bovine herpesvirus-1 gene homologous to the glycoprotein K-encoding gene of herpes simplex virus-1. Gene 168:189–193 Khadr A, Tikoo SK, Babiuk LA, van Drunen Littel-van den Hurk S (1996) Sequence and expression of a bovine herpesvirus-1 gene homologous to the glycoprotein K-encoding gene of herpes simplex virus-1. Gene 168:189–193
6.
Zurück zum Zitat Khattar SK, van Drunen Littel-van den Hurk S, Babiuk LA, Tikoo SK (1995) Identification and transcriptional analysis of a 3′-coterminal gene cluster containing UL1, UL2, UL3, and UL3.5 open reading frames of bovine herpesvirus-1. Virology 213:28–37 Khattar SK, van Drunen Littel-van den Hurk S, Babiuk LA, Tikoo SK (1995) Identification and transcriptional analysis of a 3′-coterminal gene cluster containing UL1, UL2, UL3, and UL3.5 open reading frames of bovine herpesvirus-1. Virology 213:28–37
7.
Zurück zum Zitat Klupp BG, Hengartner CJ, Mettenleiter TC, Enquist LW (2004) Complete, annotated sequence of the pseudorabies virus genome. J Virol 78:424–440PubMedCrossRef Klupp BG, Hengartner CJ, Mettenleiter TC, Enquist LW (2004) Complete, annotated sequence of the pseudorabies virus genome. J Virol 78:424–440PubMedCrossRef
8.
Zurück zum Zitat Kutish G, Mainprize T, Rock D (1990) Characterization of the latency-related transcriptionally active region of the bovine herpesvirus 1 genome. J Virol 64:5730–5737PubMed Kutish G, Mainprize T, Rock D (1990) Characterization of the latency-related transcriptionally active region of the bovine herpesvirus 1 genome. J Virol 64:5730–5737PubMed
9.
Zurück zum Zitat Muylkens B, Thiry J, Kirten P, Schynts F, Thiry E (2007) Bovine herpesvirus 1 infection and infectious bovine rhinotracheitis. Veterinary Res 38:181–209CrossRef Muylkens B, Thiry J, Kirten P, Schynts F, Thiry E (2007) Bovine herpesvirus 1 infection and infectious bovine rhinotracheitis. Veterinary Res 38:181–209CrossRef
10.
Zurück zum Zitat Robinson KE, Meers J, Gravel JL, McCarthy FM, Mahony TJ (2008) The essential and non-essential genes of Bovine herpesvirus 1. J Gen Virol 89:2851–2863PubMedCrossRef Robinson KE, Meers J, Gravel JL, McCarthy FM, Mahony TJ (2008) The essential and non-essential genes of Bovine herpesvirus 1. J Gen Virol 89:2851–2863PubMedCrossRef
11.
Zurück zum Zitat Schwyzer M, Wirth UV, Vogt B, Fraefel C (1994) BICP22 of bovine herpesvirus 1 is encoded by a spliced 1.7 kb RNA which exhibits immediate early and late transcription kinetics. J Gen Virol 75 (Pt 7):1703–1711 Schwyzer M, Wirth UV, Vogt B, Fraefel C (1994) BICP22 of bovine herpesvirus 1 is encoded by a spliced 1.7 kb RNA which exhibits immediate early and late transcription kinetics. J Gen Virol 75 (Pt 7):1703–1711
12.
Zurück zum Zitat Schwyzer M, Wirth UV, Vogt B, Fraefel C, Vlcek C, Benes V, Lu Z, Kutish G, Paces V, Rock D, Letchworth GJ, Styger D, Lowery DE, Simard C, LaBoissiere S, Misra V, Goltz M, Buhk HJ, Broll H, Lewin M, Mankertz A, Boerner B, Borchers K, Weigelt W, Bello LJ, Thiry E, Meyer G (2010) Bovine herpesvirus type 1.1 complete genome. GenBank AJ004801 Schwyzer M, Wirth UV, Vogt B, Fraefel C, Vlcek C, Benes V, Lu Z, Kutish G, Paces V, Rock D, Letchworth GJ, Styger D, Lowery DE, Simard C, LaBoissiere S, Misra V, Goltz M, Buhk HJ, Broll H, Lewin M, Mankertz A, Boerner B, Borchers K, Weigelt W, Bello LJ, Thiry E, Meyer G (2010) Bovine herpesvirus type 1.1 complete genome. GenBank AJ004801
13.
Zurück zum Zitat Smith DR, Quinlan AR, Peckham HE, Makowsky K, Tao W, Woolf B, Shen L, Donahue WF, Tusneem N, Stromberg MP, Stewart DA, Zhang L, Ranade SS, Warner JB, Lee CC, Coleman BE, Zhang Z, McLaughlin SF, Malek JA, Sorenson JM, Blanchard AP, Chapman J, Hillman D, Chen F, Rokhsar DS, McKernan KJ, Jeffries TW, Marth GT, Richardson PM (2008) Rapid whole-genome mutational profiling using next-generation sequencing technologies. Genome Res 18:1638–1642PubMedCrossRef Smith DR, Quinlan AR, Peckham HE, Makowsky K, Tao W, Woolf B, Shen L, Donahue WF, Tusneem N, Stromberg MP, Stewart DA, Zhang L, Ranade SS, Warner JB, Lee CC, Coleman BE, Zhang Z, McLaughlin SF, Malek JA, Sorenson JM, Blanchard AP, Chapman J, Hillman D, Chen F, Rokhsar DS, McKernan KJ, Jeffries TW, Marth GT, Richardson PM (2008) Rapid whole-genome mutational profiling using next-generation sequencing technologies. Genome Res 18:1638–1642PubMedCrossRef
14.
Zurück zum Zitat Walboomers JM, Schegget JT (1976) A new methods for isolation of herpes simplex virus type 2 DNA. Virology 74:256–258PubMedCrossRef Walboomers JM, Schegget JT (1976) A new methods for isolation of herpes simplex virus type 2 DNA. Virology 74:256–258PubMedCrossRef
15.
Zurück zum Zitat Wirth UV, Fraefel C, Vogt B, Vlcek C, Paces V, Schwyzer M (1992) Immediate-early RNA 2.9 and early RNA 2.6 of bovine herpesvirus 1 are 3′ coterminal and encode a putative zinc finger transactivator protein. J Virol 66:2763–2772PubMed Wirth UV, Fraefel C, Vogt B, Vlcek C, Paces V, Schwyzer M (1992) Immediate-early RNA 2.9 and early RNA 2.6 of bovine herpesvirus 1 are 3′ coterminal and encode a putative zinc finger transactivator protein. J Virol 66:2763–2772PubMed
Metadaten
Titel
Complete genome sequence of the NVSL BoHV-1.1 Cooper reference strain
verfasst von
Jean M. d’Offay
Robert W. Fulton
R. Eberle
Publikationsdatum
01.05.2013
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 5/2013
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-012-1574-6

Weitere Artikel der Ausgabe 5/2013

Archives of Virology 5/2013 Zur Ausgabe

Leitlinien kompakt für die Innere Medizin

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag

Erhebliches Risiko für Kehlkopfkrebs bei mäßiger Dysplasie

29.05.2024 Larynxkarzinom Nachrichten

Fast ein Viertel der Personen mit mäßig dysplastischen Stimmlippenläsionen entwickelt einen Kehlkopftumor. Solche Personen benötigen daher eine besonders enge ärztliche Überwachung.

Nach Herzinfarkt mit Typ-1-Diabetes schlechtere Karten als mit Typ 2?

29.05.2024 Herzinfarkt Nachrichten

Bei Menschen mit Typ-2-Diabetes sind die Chancen, einen Myokardinfarkt zu überleben, in den letzten 15 Jahren deutlich gestiegen – nicht jedoch bei Betroffenen mit Typ 1.

15% bedauern gewählte Blasenkrebs-Therapie

29.05.2024 Urothelkarzinom Nachrichten

Ob Patienten und Patientinnen mit neu diagnostiziertem Blasenkrebs ein Jahr später Bedauern über die Therapieentscheidung empfinden, wird einer Studie aus England zufolge von der Radikalität und dem Erfolg des Eingriffs beeinflusst.

Costims – das nächste heiße Ding in der Krebstherapie?

28.05.2024 Onkologische Immuntherapie Nachrichten

„Kalte“ Tumoren werden heiß – CD28-kostimulatorische Antikörper sollen dies ermöglichen. Am besten könnten diese in Kombination mit BiTEs und Checkpointhemmern wirken. Erste klinische Studien laufen bereits.

Update Innere Medizin

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.