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Erschienen in: Archives of Virology 11/2018

21.07.2018 | Annotated Sequence Record

Complete genome sequences of two gemycircularviruses associated with non-cultivated plants in Brazil

verfasst von: Rafael Reis de Rezende, Talita Bernardon Mar, Lina Marcela Cortés Páez, André da Silva Xavier, César Augusto Diniz Xavier, Jesús Navas-Castillo, Francisco Murilo Zerbini, Poliane Alfenas-Zerbini

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 11/2018

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Abstract

Gemycircularviruses (genus Gemycircularvirus, family Genomoviridae) are single-stranded DNA viruses that are spread around the world in association with several organisms and environments. In this work, we identified two gemycircularviruses associated with two non-cultivated plants in Brazil, Momordica charantia and Euphorbia heterophylla. Both viruses display the general genome structure of gemycircularviruses. The virus isolated from M. charantia showed the highest nucleotide sequence identity with Pteropus associated gemycircularvirus 5, and an atypical structure consisting of a hairpin embedded in the major stem-loop was observed in the intergenic region. The virus from E. heterophylla showed the highest nucleotide sequence identity with Odonata associated gemycircularvirus 1. Phylogenetic analysis groups the two new viruses together with other genomoviruses of the genus Gemycircularvirus.
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Literatur
3.
Zurück zum Zitat Doyle JJ, Doyle JL (1987) A rapid DNA isolation procedure for small amounts of fresh leaf tissue. Phytochem Bull 19:11–15 Doyle JJ, Doyle JL (1987) A rapid DNA isolation procedure for small amounts of fresh leaf tissue. Phytochem Bull 19:11–15
Metadaten
Titel
Complete genome sequences of two gemycircularviruses associated with non-cultivated plants in Brazil
verfasst von
Rafael Reis de Rezende
Talita Bernardon Mar
Lina Marcela Cortés Páez
André da Silva Xavier
César Augusto Diniz Xavier
Jesús Navas-Castillo
Francisco Murilo Zerbini
Poliane Alfenas-Zerbini
Publikationsdatum
21.07.2018
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 11/2018
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-018-3924-5

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