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Erschienen in: Archives of Virology 4/2016

05.01.2016 | Brief Report

Detection and genetic characterization of a novel parvovirus distantly related to human bufavirus in domestic pigs

verfasst von: Renáta Hargitai, Péter Pankovics, Attila Mihály Kertész, Hunor Bíró, Ákos Boros, Tung Gia Phan, Eric Delwart, Gábor Reuter

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 4/2016

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Abstract

In this study, a novel parvovirus (strain swine/Zsana3/2013/HUN, KT965075) was detected in domestic pigs and genetically characterized by viral metagenomics and PCR methods. The novel parvovirus was distantly related to the human bufaviruses and was detected in 19 (90.5 %) of the 21 and five (33.3 %) of the 15 faecal samples collected from animals with and without cases of posterior paraplegia of unknown etiology from five affected farms and one control farm in Hungary, respectively. Swine/Zsana3/2013/HUN is highly prevalent in domestic pigs and potentially represents a novel parvovirus species in the subfamily Parvovirinae.
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Altay A, Yahiro T, Bozdayi G, Matschumoto T, Sahin F, Ozkan S, Nishizono A, Söderlund-Venermo M, Ahmed K (2015) Bufavirus genotype 3 in Turkish children with severe diarrhoea. Clin Microbiol Infect 21(10):965.e1–965.e4CrossRef Altay A, Yahiro T, Bozdayi G, Matschumoto T, Sahin F, Ozkan S, Nishizono A, Söderlund-Venermo M, Ahmed K (2015) Bufavirus genotype 3 in Turkish children with severe diarrhoea. Clin Microbiol Infect 21(10):965.e1–965.e4CrossRef
2.
Zurück zum Zitat Boros A, Pankovics P, Simmonds P, Reuter G (2011) Novel positive-sense, single-stranded RNA (+ssRNA) virus with di-cistronic genome from intestinal content of freshwater carp (Cyprinus carpio). PLoS One 6:e29145CrossRefPubMedPubMedCentral Boros A, Pankovics P, Simmonds P, Reuter G (2011) Novel positive-sense, single-stranded RNA (+ssRNA) virus with di-cistronic genome from intestinal content of freshwater carp (Cyprinus carpio). PLoS One 6:e29145CrossRefPubMedPubMedCentral
3.
Zurück zum Zitat Chieochansin T, Vutithanachot V, Theamboonlers A, Poovorawan Y (2015) Bufavirus in fecal specimens of patients with and without diarrhea in Thailand. Arch Virol 160:1781–1784CrossRefPubMed Chieochansin T, Vutithanachot V, Theamboonlers A, Poovorawan Y (2015) Bufavirus in fecal specimens of patients with and without diarrhea in Thailand. Arch Virol 160:1781–1784CrossRefPubMed
5.
Zurück zum Zitat Cotmore SF, Agbandje-McKenna M, Chiorini JA, Mukha DV, Pintel DJ, Qiu J, Söderlund-Venermo M, Tattersall P, Tijssen P, Gatherer D, Davison AJ (2014) The family Parvoviridae. Arch Virol 159:1239–1247CrossRefPubMedPubMedCentral Cotmore SF, Agbandje-McKenna M, Chiorini JA, Mukha DV, Pintel DJ, Qiu J, Söderlund-Venermo M, Tattersall P, Tijssen P, Gatherer D, Davison AJ (2014) The family Parvoviridae. Arch Virol 159:1239–1247CrossRefPubMedPubMedCentral
6.
Zurück zum Zitat Handley SA, Thackray LB, Zhao G, Presti R, Miller AD, Droit L, Abbink P, Maxfield LF, Kambal A, Duan E, Stanley K, Kramer J, Macri SC, Permar SR, Schmitz JE, Mansfield K, Brenchley JM, Veazey RS, Stappenbeck TS, Wang D, Barouch DH, Virgin HW (2012) Pathogenic simian immunodeficiency virus infection is associated with expansion of the enteric virome. Cell 151(2):253–266CrossRefPubMedPubMedCentral Handley SA, Thackray LB, Zhao G, Presti R, Miller AD, Droit L, Abbink P, Maxfield LF, Kambal A, Duan E, Stanley K, Kramer J, Macri SC, Permar SR, Schmitz JE, Mansfield K, Brenchley JM, Veazey RS, Stappenbeck TS, Wang D, Barouch DH, Virgin HW (2012) Pathogenic simian immunodeficiency virus infection is associated with expansion of the enteric virome. Cell 151(2):253–266CrossRefPubMedPubMedCentral
7.
Zurück zum Zitat Huang DD, Wang W, Lu QB, Zhao J, Guo CT, Wang HY, Zhang XA, Tong YG, Liu W, Cao WC (2015) Identification of bufavirus-1 and bufavirus-3 in feces of patients with acute diarrhea, China. Sci Rep 19:13272CrossRef Huang DD, Wang W, Lu QB, Zhao J, Guo CT, Wang HY, Zhang XA, Tong YG, Liu W, Cao WC (2015) Identification of bufavirus-1 and bufavirus-3 in feces of patients with acute diarrhea, China. Sci Rep 19:13272CrossRef
8.
Zurück zum Zitat Kemenesi G, Dallos B, Görföl T, Estók P, Boldogh S, Kurucz K, Oldal M, Marton S, Bányai K, Jakab F (2015) Genetic diversity and recombination within bufaviruses: detection of a novel strain in Hungarian bats. Infect Genet Evol 33:288–292CrossRefPubMed Kemenesi G, Dallos B, Görföl T, Estók P, Boldogh S, Kurucz K, Oldal M, Marton S, Bányai K, Jakab F (2015) Genetic diversity and recombination within bufaviruses: detection of a novel strain in Hungarian bats. Infect Genet Evol 33:288–292CrossRefPubMed
9.
Zurück zum Zitat Phan TG, Vo NP, Bonkoungou IJ, Kapoor A, Barro N, O’Ryan M, Kapusinszky B, Wang C, Delwart E (2012) Acute diarrhea in West African children: diverse enteric viruses and novel parvovirus genus. J Virol 86:11024–11030CrossRefPubMedPubMedCentral Phan TG, Vo NP, Bonkoungou IJ, Kapoor A, Barro N, O’Ryan M, Kapusinszky B, Wang C, Delwart E (2012) Acute diarrhea in West African children: diverse enteric viruses and novel parvovirus genus. J Virol 86:11024–11030CrossRefPubMedPubMedCentral
10.
Zurück zum Zitat Phan TG, Vo NP, Boros Á, Pankovics P, Reuter G, Li OTW, Wang C, Deng X, Poon LLM, Delwart E (2013) The viruses of wild pigeon droppings. PLoS One 8(9):e72787CrossRefPubMedPubMedCentral Phan TG, Vo NP, Boros Á, Pankovics P, Reuter G, Li OTW, Wang C, Deng X, Poon LLM, Delwart E (2013) The viruses of wild pigeon droppings. PLoS One 8(9):e72787CrossRefPubMedPubMedCentral
11.
Zurück zum Zitat Reynolds KJ, Sheridan M, Preugschas K (2013) Posterior paresis and paralysis associated with spinal cord vacuolation in late finisher pigs. Poster 40; American Association of Swine Veterinarians (AASV) 2013 annual meeting, San Diego. Program book page 339 Reynolds KJ, Sheridan M, Preugschas K (2013) Posterior paresis and paralysis associated with spinal cord vacuolation in late finisher pigs. Poster 40; American Association of Swine Veterinarians (AASV) 2013 annual meeting, San Diego. Program book page 339
12.
Zurück zum Zitat Sasaki M, Orba Y, Anindita PD, Ishii A, Ueno K, Hang’ombe BM, Mweene AS, Ito K, Sawa H (2015) Distinct lineages of bufavirus in wild shrews and nonhuman primates. Emerg Infect Dis 21:1230–1233CrossRefPubMedPubMedCentral Sasaki M, Orba Y, Anindita PD, Ishii A, Ueno K, Hang’ombe BM, Mweene AS, Ito K, Sawa H (2015) Distinct lineages of bufavirus in wild shrews and nonhuman primates. Emerg Infect Dis 21:1230–1233CrossRefPubMedPubMedCentral
13.
Zurück zum Zitat Smith SL, Schapendonk CM, van Beek J, Vennema H, Schürch AC, Schipper D, Bodewes R, Haagmans BL, Osterhaus AD, Koopmans MP (2014) New viruses in idiopathic human diarrhea cases, the Netherlands. Emerg Infect Dis 20:1218–1222CrossRef Smith SL, Schapendonk CM, van Beek J, Vennema H, Schürch AC, Schipper D, Bodewes R, Haagmans BL, Osterhaus AD, Koopmans MP (2014) New viruses in idiopathic human diarrhea cases, the Netherlands. Emerg Infect Dis 20:1218–1222CrossRef
14.
Zurück zum Zitat Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S (2013) MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 30:2725–2729CrossRefPubMedPubMedCentral Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S (2013) MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 30:2725–2729CrossRefPubMedPubMedCentral
15.
Zurück zum Zitat Tijssen P, Agbandje-McKenna M, Almendral JM, Bergoin M, Flegel TW, Hedman K, Kleinschmidt J, Li Y, Pintel DJ, Tattersall P (2011) The family Parvoviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) Virus taxonomy—ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier/Academic Press, London, pp 405–425 Tijssen P, Agbandje-McKenna M, Almendral JM, Bergoin M, Flegel TW, Hedman K, Kleinschmidt J, Li Y, Pintel DJ, Tattersall P (2011) The family Parvoviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) Virus taxonomy—ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier/Academic Press, London, pp 405–425
16.
Zurück zum Zitat Väisänen E, Kuisma I, Phan TG, Delwart E, Lappalainen M, Tarkka E, Hedman K, Söderlund-Venermo M (2014) Bufavirus in feces of patients with gastroenteritis, Finland. Emerg Infect Dis 20:1077–1080CrossRefPubMedPubMedCentral Väisänen E, Kuisma I, Phan TG, Delwart E, Lappalainen M, Tarkka E, Hedman K, Söderlund-Venermo M (2014) Bufavirus in feces of patients with gastroenteritis, Finland. Emerg Infect Dis 20:1077–1080CrossRefPubMedPubMedCentral
17.
Zurück zum Zitat Victoria JG, Kapoor A, Li L, Blinkova O, Slikas B, Wang C, Naeem A, Zaidi S, Delwart E (2009) Metagenomic analysis of viruses in stool samples from children with acute flaccid paralysis. J Virol 83:4642–4651CrossRefPubMedPubMedCentral Victoria JG, Kapoor A, Li L, Blinkova O, Slikas B, Wang C, Naeem A, Zaidi S, Delwart E (2009) Metagenomic analysis of viruses in stool samples from children with acute flaccid paralysis. J Virol 83:4642–4651CrossRefPubMedPubMedCentral
18.
Zurück zum Zitat Yahiro T, Wangchuk S, Tshering K, Bandhari P, Zangmo S, Dorji T, Tshering K, Matsumoto T, Nishizono A, Söderlund-Venermo M, Ahmed K (2014) Novel human bufavirus genotype 3 in children with severe diarrhea, Bhutan. Emerg Infect Dis 20:1037–1039CrossRefPubMedPubMedCentral Yahiro T, Wangchuk S, Tshering K, Bandhari P, Zangmo S, Dorji T, Tshering K, Matsumoto T, Nishizono A, Söderlund-Venermo M, Ahmed K (2014) Novel human bufavirus genotype 3 in children with severe diarrhea, Bhutan. Emerg Infect Dis 20:1037–1039CrossRefPubMedPubMedCentral
Metadaten
Titel
Detection and genetic characterization of a novel parvovirus distantly related to human bufavirus in domestic pigs
verfasst von
Renáta Hargitai
Péter Pankovics
Attila Mihály Kertész
Hunor Bíró
Ákos Boros
Tung Gia Phan
Eric Delwart
Gábor Reuter
Publikationsdatum
05.01.2016
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 4/2016
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-015-2732-4

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