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Archives of Virology

Erschienen in:

04.06.2019 | Annotated Sequence Record

Full genome sequence of a new polymycovirus infecting Fusarium redolens

verfasst von: Mathieu Mahillon, Alain Decroës, Charlotte Liénard, Claude Bragard, Anne Legrève

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 8/2019

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Abstract

By screening a collection of Fusarium spp. for the presence of dsRNA, the Fusarium redolens strain A63-1 was found harboring a pattern of multiple dsRNA bands when analyzed by agarose gel electrophoresis. Using NextSeq Illumina sequencing, the full sequences of eight dsRNA molecules were determined, compared to databases, and gathered into a new viral genome. This novel virus shares similarities with mycoviruses that were recently grouped in the proposed family “Polymycoviridae”. Hence, the name “Fusarium redolens polymycovirus 1” is proposed for this virus. Each viral dsRNA contains only one ORF, except dsRNA 7, which has an additional one. Based on amino acid sequence similarities, the functions of the proteins encoded by dsRNA 1–4 can be hypothesized. On the other hand, the putative proteins encoded by dsRNA 5–8 exhibit no relevant homology to known proteins. In this report, the full genome sequence of this new virus is presented along with a primary bioinformatics analysis.

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Titel: Full genome sequence of a new polymycovirus infecting Fusarium redolens
verfasst von: Mathieu Mahillon
Alain Decroës
Charlotte Liénard
Claude Bragard
Anne Legrève
Publikationsdatum: 04.06.2019
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 8/2019
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-019-04301-1

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