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Archives of Virology

Erschienen in:

09.01.2021 | Annotated Sequence Record

Genomic characterization of a nebovirus strain with a novel RdRp genotype in yaks

verfasst von: Siyi Li, Huiqiang Ma, Zhonghua Yu, Hua Yue, Cheng Tang

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 3/2021

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Abstract

Neboviruses (NeVs) are important causative agents of calf diarrhea that belong to the family Caliciviridae. In this study, we investigated the genomic characteristics of a NeV strain from yaks that has a novel RdRp genotype. The complete genome of this strain (YAK/NRG-A9/19/CH) is 7454 nt in length and shares 68.3%-79.7% nt sequence identity with those of other NeVs. The RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) gene of this strain shares 66.5%-78.5% nt sequence identity (74.0%-89.3% aa sequence identity) with the eight available complete NeV RdRp sequences, and a phylogenetic analysis based on these sequences showed that the new strain formed an independent branch, indicating that the RdRp of strain YAK/NRG-A9/19/CH may represent a novel RdRp genotype of NeV. These results contribute to a further understanding of the molecular characteristics and genetic evolution of NeVs.

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Titel: Genomic characterization of a nebovirus strain with a novel RdRp genotype in yaks
verfasst von: Siyi Li
Huiqiang Ma
Zhonghua Yu
Hua Yue
Cheng Tang
Publikationsdatum: 09.01.2021
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 3/2021
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-020-04951-6

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