Skip to main content
Erschienen in: Archives of Virology 6/2018

09.02.2018 | Brief Report

Genotypic variability analysis of DENV-1 in Mexico reveals the presence of a novel Mexican lineage

verfasst von: Elizabeth González-Durán, Mauricio Vázquez-Pichardo, Jesús Miguel Torres-Flores, Fabiola Garcés-Ayala, Alfonso Méndez-Tenorio, Everardo Curiel-Quesada, Joanna María Ortiz-Alcántara, Hugo Gildardo Castelán-Sánchez, Juan Santiago Salas-Benito, Belem Torres-Longoria, Irma López-Martínez, Lucía Hernández-Rivas, Jorge Membrillo-Hernández, José Alberto Díaz-Quiñonez, José Ernesto Ramírez-González

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 6/2018

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

Here, we report for the first time the circulation of dengue virus type 1 (DENV-1) belonging to the lineage IV of genotype V (African American genotype) based on phylogenetic analysis of nucleotide sequences from 10 DENV-1-positive samples obtained in Mexico between 2012 and 2014. Our data revealed that the lineages III and IV of DENV-1 genotype V were found circulating during the same period, probably explaining the rise in the number of cases of severe dengue during that period.
Anhänge
Nur mit Berechtigung zugänglich
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Calisher CH, Karabatsos N (1988) Arbovirus serogroups: definition and geographic distribution. In: Monath TP (ed) The arboviruses: epidemiology and ecology, vol I. CRC Press Inc., Boca Raton, pp 22–23 Calisher CH, Karabatsos N (1988) Arbovirus serogroups: definition and geographic distribution. In: Monath TP (ed) The arboviruses: epidemiology and ecology, vol I. CRC Press Inc., Boca Raton, pp 22–23
2.
Zurück zum Zitat Carrillo VE, Danis LR, Velasco HJX, Sanchez BG, Alpuche C, Lopez I et al (2010) Evolution of dengue virus in Mexico is characterized by frequent lineage replacement. Arch Virol 155:1401–1412CrossRef Carrillo VE, Danis LR, Velasco HJX, Sanchez BG, Alpuche C, Lopez I et al (2010) Evolution of dengue virus in Mexico is characterized by frequent lineage replacement. Arch Virol 155:1401–1412CrossRef
4.
Zurück zum Zitat Diaz FJ, Black WC, Farfan-Ale JA, Lorono-Pino MA, Olson KE, Beaty BJ (2006) Dengue virus circulation and evolution in Mexico: a phylogenetic perspective. Arch Med Res 37:760–773CrossRefPubMed Diaz FJ, Black WC, Farfan-Ale JA, Lorono-Pino MA, Olson KE, Beaty BJ (2006) Dengue virus circulation and evolution in Mexico: a phylogenetic perspective. Arch Med Res 37:760–773CrossRefPubMed
5.
Zurück zum Zitat dos Santos FB, Nogueira FB, Castro MG, Nunes PC, de Filippis AM, Faria NR, Simoes JBS, Sampaio SA, Santos CR, Nogueira RMR (2011) First report of multiple lineages of dengue viruses type 1 in Rio de Janeiro, Brazil. Virol J 8:387CrossRefPubMedCentralPubMed dos Santos FB, Nogueira FB, Castro MG, Nunes PC, de Filippis AM, Faria NR, Simoes JBS, Sampaio SA, Santos CR, Nogueira RMR (2011) First report of multiple lineages of dengue viruses type 1 in Rio de Janeiro, Brazil. Virol J 8:387CrossRefPubMedCentralPubMed
6.
Zurück zum Zitat Felsenstein J (2005) PHYLIP (Phylogeny Inference Package) version 3.6. Distributed by the author. Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle Felsenstein J (2005) PHYLIP (Phylogeny Inference Package) version 3.6. Distributed by the author. Department of Genome Sciences, University of Washington, Seattle
7.
Zurück zum Zitat Field D, Tiwari B, Booth T, Houten S, Swan D, Bertrand N, Thurston M (2006) Open software for biologists: from famine to feast. Nat Biotechnol 24:801–803CrossRefPubMed Field D, Tiwari B, Booth T, Houten S, Swan D, Bertrand N, Thurston M (2006) Open software for biologists: from famine to feast. Nat Biotechnol 24:801–803CrossRefPubMed
8.
Zurück zum Zitat Goncalvez AP, Escalante AA, Pujol FH, Ludert JE, Tovar D, Salas RA, Liprandi F (2002) Diversity and evolution of the envelope gene of dengue virus type 1. Virology 303:110–119CrossRefPubMed Goncalvez AP, Escalante AA, Pujol FH, Ludert JE, Tovar D, Salas RA, Liprandi F (2002) Diversity and evolution of the envelope gene of dengue virus type 1. Virology 303:110–119CrossRefPubMed
9.
Zurück zum Zitat Jones JM, Lopez B, Adams L et al (2016) Binational dengue outbreak along the United States Mexico border Yuma County, Arizona and Sonora, Mexico, 2014. MMWR Morth Mortal Wkly Rep 65:495–499CrossRef Jones JM, Lopez B, Adams L et al (2016) Binational dengue outbreak along the United States Mexico border Yuma County, Arizona and Sonora, Mexico, 2014. MMWR Morth Mortal Wkly Rep 65:495–499CrossRef
10.
Zurück zum Zitat Kumar S, Stecher G, Tamura K (2016) MEGA 7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0. Mol Biol Evol 33(7):1870–1874CrossRefPubMed Kumar S, Stecher G, Tamura K (2016) MEGA 7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0. Mol Biol Evol 33(7):1870–1874CrossRefPubMed
11.
Zurück zum Zitat Loroño-Pino MA, Cropp CB, Farfán JA, Vorndam AV, Rodríguez-Angulo EM, Rosado-Paredes EP, Flores- Flores LF, Beaty BJ, Gubler DJ (1999) Common occurrence of concurrent infections by multiple dengue virus serotypes. Am J Trop Med Hyg 61(5):725–730CrossRefPubMed Loroño-Pino MA, Cropp CB, Farfán JA, Vorndam AV, Rodríguez-Angulo EM, Rosado-Paredes EP, Flores- Flores LF, Beaty BJ, Gubler DJ (1999) Common occurrence of concurrent infections by multiple dengue virus serotypes. Am J Trop Med Hyg 61(5):725–730CrossRefPubMed
12.
Zurück zum Zitat Muñoz-Ramírez ZY, Mendez-Tenorio A, Kato I, Bravo MM, Rizzato C, Thorell K, Torres R, Aviles-Jimenez F, Camorlinga M, Canzian F, Torres J (2017) Whole genome sequence and phylogenetic analysis show Helicobacter pylori strains from Latin America have followed a unique evolution pathway. Front Cell Infect Microbiol 7:50CrossRefPubMedCentralPubMed Muñoz-Ramírez ZY, Mendez-Tenorio A, Kato I, Bravo MM, Rizzato C, Thorell K, Torres R, Aviles-Jimenez F, Camorlinga M, Canzian F, Torres J (2017) Whole genome sequence and phylogenetic analysis show Helicobacter pylori strains from Latin America have followed a unique evolution pathway. Front Cell Infect Microbiol 7:50CrossRefPubMedCentralPubMed
14.
Zurück zum Zitat Pickett BE, Sadat EL, Zhang Y, Noronha JM, Squires RB, Hunt V, Liu M, Kumar S, Zaremba S, Gu Z, Zhou L, Larson CN, Dietrich J, Klem EB, Scheuermann RH (2012) ViPR: an open bioinformatics database and analysis resource for virology research. Nucleic Acids Res 40(Database issue):D593–D598CrossRefPubMed Pickett BE, Sadat EL, Zhang Y, Noronha JM, Squires RB, Hunt V, Liu M, Kumar S, Zaremba S, Gu Z, Zhou L, Larson CN, Dietrich J, Klem EB, Scheuermann RH (2012) ViPR: an open bioinformatics database and analysis resource for virology research. Nucleic Acids Res 40(Database issue):D593–D598CrossRefPubMed
15.
Zurück zum Zitat Ramos CJ, dos Barreto SF, Martínez VR, de Galvão AJM, Joint G, Sarti E (2017) Dengue in Latin America: systematic review of molecular epidemiological trends. PLoS Negl Trop Dis 11(1):e0005224CrossRef Ramos CJ, dos Barreto SF, Martínez VR, de Galvão AJM, Joint G, Sarti E (2017) Dengue in Latin America: systematic review of molecular epidemiological trends. PLoS Negl Trop Dis 11(1):e0005224CrossRef
16.
Zurück zum Zitat Rico-Hesse R (1990) Molecular evolution and distribution of dengue viruses type 1 and 2 in nature. Virology 174:479–493CrossRefPubMed Rico-Hesse R (1990) Molecular evolution and distribution of dengue viruses type 1 and 2 in nature. Virology 174:479–493CrossRefPubMed
17.
Zurück zum Zitat San Martin JL, Brathwaite O, Zambrano B, Solorzano JO, Bouckenooghe A et al (2010) The epidemiology of dengue in the Americas over the last three decades: a worrisome reality. Am J Trop Med Hyg 82:128–135CrossRefPubMedCentralPubMed San Martin JL, Brathwaite O, Zambrano B, Solorzano JO, Bouckenooghe A et al (2010) The epidemiology of dengue in the Americas over the last three decades: a worrisome reality. Am J Trop Med Hyg 82:128–135CrossRefPubMedCentralPubMed
18.
Zurück zum Zitat Shin D, Richards SL, Alto BW, Bettinardi DJ, Smartt CT (2012) Genome sequence analysis of dengue virus 1 isolated in Key West, Florida. PLoS One 8(9):e74582CrossRef Shin D, Richards SL, Alto BW, Bettinardi DJ, Smartt CT (2012) Genome sequence analysis of dengue virus 1 isolated in Key West, Florida. PLoS One 8(9):e74582CrossRef
Metadaten
Titel
Genotypic variability analysis of DENV-1 in Mexico reveals the presence of a novel Mexican lineage
verfasst von
Elizabeth González-Durán
Mauricio Vázquez-Pichardo
Jesús Miguel Torres-Flores
Fabiola Garcés-Ayala
Alfonso Méndez-Tenorio
Everardo Curiel-Quesada
Joanna María Ortiz-Alcántara
Hugo Gildardo Castelán-Sánchez
Juan Santiago Salas-Benito
Belem Torres-Longoria
Irma López-Martínez
Lucía Hernández-Rivas
Jorge Membrillo-Hernández
José Alberto Díaz-Quiñonez
José Ernesto Ramírez-González
Publikationsdatum
09.02.2018
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 6/2018
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-018-3759-0

Weitere Artikel der Ausgabe 6/2018

Archives of Virology 6/2018 Zur Ausgabe

Leitlinien kompakt für die Innere Medizin

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag

Notfall-TEP der Hüfte ist auch bei 90-Jährigen machbar

26.04.2024 Hüft-TEP Nachrichten

Ob bei einer Notfalloperation nach Schenkelhalsfraktur eine Hemiarthroplastik oder eine totale Endoprothese (TEP) eingebaut wird, sollte nicht allein vom Alter der Patientinnen und Patienten abhängen. Auch über 90-Jährige können von der TEP profitieren.

Niedriger diastolischer Blutdruck erhöht Risiko für schwere kardiovaskuläre Komplikationen

25.04.2024 Hypotonie Nachrichten

Wenn unter einer medikamentösen Hochdrucktherapie der diastolische Blutdruck in den Keller geht, steigt das Risiko für schwere kardiovaskuläre Ereignisse: Darauf deutet eine Sekundäranalyse der SPRINT-Studie hin.

Bei schweren Reaktionen auf Insektenstiche empfiehlt sich eine spezifische Immuntherapie

Insektenstiche sind bei Erwachsenen die häufigsten Auslöser einer Anaphylaxie. Einen wirksamen Schutz vor schweren anaphylaktischen Reaktionen bietet die allergenspezifische Immuntherapie. Jedoch kommt sie noch viel zu selten zum Einsatz.

Therapiestart mit Blutdrucksenkern erhöht Frakturrisiko

25.04.2024 Hypertonie Nachrichten

Beginnen ältere Männer im Pflegeheim eine Antihypertensiva-Therapie, dann ist die Frakturrate in den folgenden 30 Tagen mehr als verdoppelt. Besonders häufig stürzen Demenzkranke und Männer, die erstmals Blutdrucksenker nehmen. Dafür spricht eine Analyse unter US-Veteranen.

Update Innere Medizin

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.