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Advances in Therapy
Erschienen in: Advances in Therapy 4/2024

29.02.2024 | Original Research

Identification of a Group of Therapeutic Targets and Prognostic Biomarker for Triple Negative Breast Cancer

verfasst von: Yan Li, Shengjie Yang, Lu Qi, Yinjuan Li, Xinghe Wang

Erschienen in: Advances in Therapy | Ausgabe 4/2024

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Abstract

Introduction

Triple-negative breast cancer (TNBC) is a highly heterogeneous disease. Mining differentially expressed genes of TNBC is helpful to explore new therapeutic targets. This study aimed to investigate diagnostic biomarker genes in TNBC compared to normal tissue. Additionally, we explored the functions and prognostic value of these key genes as well as potential targeted drugs that could affect these genes.

Methods

Differential gene expression analysis was conducted using the R software with data from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Then, the identified differentially expressed genes (DEGs) were used to construct a protein-protein interaction (PPI) network using the Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes (STRING) database and Cytoscape software. The mRNA expression levels of key genes were analyzed using the UALCAN database with data from The Cancer Genome Atlas (TCGA). Enrichment and survival analyses were performed using R software. In addition, potential compounds showing sensitivity to key genes were identified by gene set cancer analysis (GSCA).

Results

Compared with normal tissues, a total of 203 DEGs were upregulated in TNBC. These DEGs participated in various biological processes including nuclear division, microtubule binding, cell cycle, and the p53 signaling pathway. Through the PPI network analysis, ten key genes were identified, among which four genes showed significant correlation with poor progression-free interval (PFI) in patients with TNBC. Moreover, the four survival-related genes were found to act as sensitive therapeutic targets.

Conclusion

The identified four key genes were considered new biomarkers for diagnosis and prognosis and also potential therapeutic targets for TNBC.
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Metadaten
Titel
Identification of a Group of Therapeutic Targets and Prognostic Biomarker for Triple Negative Breast Cancer
verfasst von
Yan Li
Shengjie Yang
Lu Qi
Yinjuan Li
Xinghe Wang
Publikationsdatum
29.02.2024
Verlag
Springer Healthcare
Erschienen in
Advances in Therapy / Ausgabe 4/2024
Print ISSN: 0741-238X
Elektronische ISSN: 1865-8652
DOI
https://doi.org/10.1007/s12325-024-02806-z

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