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Erschienen in: Annals of Surgical Oncology 12/2010

01.12.2010 | Translational Research and Biomarkers

Improved Testing for Microsatellite Instability in Colorectal Cancer Using a Simplified 3-Marker Assay

verfasst von: Iyare Esemuede, MD, Ann Forslund, PhD, Sajid A. Khan, MD, Li-Xuan Qin, PhD, Mark I. Gimbel, MD, Garrett M. Nash, MD, Zhaoshi Zeng, MD, Shoshana Rosenberg, MS, Jinru Shia, MD, Francis Barany, PhD, Philip B. Paty, MD

Erschienen in: Annals of Surgical Oncology | Ausgabe 12/2010

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Abstract

Background

In colorectal cancer (CRC), microsatellite instability (MSI) is a valuable marker of defective DNA mismatch repair that identifies cancers with distinct phenotypic properties, including favorable survival. However, the optimal assay for MSI status is unknown. We have evaluated a simplified 3-marker assay for MSI and compared it with the 5-marker (NCI) assay to see if technical variations in MSI testing are important.

Materials and Methods

DNA samples from 357 CRCs were evaluated for MSI using the 5 microsatellite markers recommended for the NCI assay (BAT 25, BAT26, D2S123, D5S346, and D17S250). Results were compared with a simplified 3-marker assay (BAT25, BAT26, and D2S123). CRCs identified as MSI were evaluated for their clinical, pathological, and genetic characteristics.

Results

The 5-marker assay identified 96 cancers as MSI. Only 56 of these were MSI by the 3-marker assay (3-marker+ group), leaving 40 cases identified as MSI only by NCI criteria (3-marker− group). The remaining 261 cancers were microsatellite stable (MSS). The 3-marker+ MSI tumors had features characteristic of MSI tumors: more proximal, poorly differentiated, associated with hereditary nonpolyposis colorectal cancer (HNPCC), more BRAF mutations, fewer KRAS mutations, better 5-year disease-specific survival, more frequent mismatch repair (MMR) protein loss, and less likely to be metastatic on presentation (P < .05). Chromosomal arm loss was observed only in 3-marker− MSI and MSS cancers (P < .05).

Conclusion

The 3-marker MSI assay outperforms the traditional 5-marker assay for identifying patients with favorable prognosis and homogeneous clinical and genetic features. More accurate MSI testing should improve prognostic and predictive scoring systems for colorectal cancer.
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Metadaten
Titel
Improved Testing for Microsatellite Instability in Colorectal Cancer Using a Simplified 3-Marker Assay
verfasst von
Iyare Esemuede, MD
Ann Forslund, PhD
Sajid A. Khan, MD
Li-Xuan Qin, PhD
Mark I. Gimbel, MD
Garrett M. Nash, MD
Zhaoshi Zeng, MD
Shoshana Rosenberg, MS
Jinru Shia, MD
Francis Barany, PhD
Philip B. Paty, MD
Publikationsdatum
01.12.2010
Verlag
Springer-Verlag
Erschienen in
Annals of Surgical Oncology / Ausgabe 12/2010
Print ISSN: 1068-9265
Elektronische ISSN: 1534-4681
DOI
https://doi.org/10.1245/s10434-010-1147-4

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