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Erschienen in: Archives of Virology 6/2019

15.04.2019 | Annotated Sequence Record

Grapevine virus M, a novel vitivirus discovered in the American hybrid bunch grape cultivar Blanc du Bois in Texas

verfasst von: Olufemi J. Alabi, Sheila McBride, David N. Appel, Maher Al Rwahnih, Fran M. Pontasch

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 6/2019

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Abstract

A novel ssRNA (+) virus with molecular properties typical of members of the genus Vitivirus (family Betaflexiviridae; subfamily Trivirinae) was discovered by high-throughput sequencing in samples of the American hybrid bunch grape cultivar Blanc du Bois in Texas. The results were independently confirmed by Sanger sequencing of the virus isolate, whose genome length is 7,387 nt, excluding the polyA tail. The genome sequence contains five ORFs that are homologous and phylogenetically related to ORFs of grapevine-infecting vitiviruses. The name “grapevine virus M” is proposed for this new virus, whose sequence divergence exceeds the current ICTV species demarcation threshold for the genus Vitivirus.
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Minafra A, Mawassi M, Goszczynski D, Saldarelli P (2017) Grapevine vitiviruses. In: Meng B, Martelli G, Golino D, Fuchs M (eds) Grapevine viruses: molecular biology, diagnostics and management. Springer, Cham, pp 229–256CrossRef Minafra A, Mawassi M, Goszczynski D, Saldarelli P (2017) Grapevine vitiviruses. In: Meng B, Martelli G, Golino D, Fuchs M (eds) Grapevine viruses: molecular biology, diagnostics and management. Springer, Cham, pp 229–256CrossRef
2.
Zurück zum Zitat Tzanetakis IE, Postman JD, Martin RR (2007) Identification, detection and transmission of a new vitivirus from Mentha. Arch Virol 152:2027–2033CrossRefPubMed Tzanetakis IE, Postman JD, Martin RR (2007) Identification, detection and transmission of a new vitivirus from Mentha. Arch Virol 152:2027–2033CrossRefPubMed
3.
Zurück zum Zitat Bem F, Murant AF (1979) Transmission and differentiation of six viruses infecting hogweed (Heracleum sphondylium) in Scotland. Ann Appl Biol 92:237–242CrossRef Bem F, Murant AF (1979) Transmission and differentiation of six viruses infecting hogweed (Heracleum sphondylium) in Scotland. Ann Appl Biol 92:237–242CrossRef
4.
Zurück zum Zitat Adams MJ, Candresse T, Hammond J, Kreuze JF, Martelli GP, Namba S, Pearson MN, Ryu KH, Saldarelli P, Yoshikawa N (2012) Family betaflexiviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) Virus taxonomy, vol 152. 9th Report of the ICTV. Elsevier, Academic Press, Amsterdam, pp 2027–2033 Adams MJ, Candresse T, Hammond J, Kreuze JF, Martelli GP, Namba S, Pearson MN, Ryu KH, Saldarelli P, Yoshikawa N (2012) Family betaflexiviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) Virus taxonomy, vol 152. 9th Report of the ICTV. Elsevier, Academic Press, Amsterdam, pp 2027–2033
5.
Zurück zum Zitat Al Rwahnih M, Alabi OJ, Westrick NM, Golino D, Rowhani A (2017) Description of a novel monopartite geminivirus and its defective subviral genome in grapevine. Phytopathology 107:240–251CrossRefPubMed Al Rwahnih M, Alabi OJ, Westrick NM, Golino D, Rowhani A (2017) Description of a novel monopartite geminivirus and its defective subviral genome in grapevine. Phytopathology 107:240–251CrossRefPubMed
6.
Zurück zum Zitat Al Rwahnih M, Rowhani A, Westrick N, Stevens K, Diaz-Lara A, Trouillas F, Preece J, Kallsen CE, Farrar K, Golino DA (2018) Discovery of viruses and virus-like pathogens in pistachio using high-throughput sequencing. Plant Dis 102:1419–1425CrossRefPubMed Al Rwahnih M, Rowhani A, Westrick N, Stevens K, Diaz-Lara A, Trouillas F, Preece J, Kallsen CE, Farrar K, Golino DA (2018) Discovery of viruses and virus-like pathogens in pistachio using high-throughput sequencing. Plant Dis 102:1419–1425CrossRefPubMed
7.
Zurück zum Zitat Candresse T, Theil S, Faure C, Marais A (2017) Determination of the complete genomic sequence of grapevine virus H, a novel vitivirus infecting grapevine. Arch Virol 163:277–280CrossRefPubMed Candresse T, Theil S, Faure C, Marais A (2017) Determination of the complete genomic sequence of grapevine virus H, a novel vitivirus infecting grapevine. Arch Virol 163:277–280CrossRefPubMed
9.
Zurück zum Zitat Hall TA (1999) BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symp Ser 41:95–98 Hall TA (1999) BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symp Ser 41:95–98
Metadaten
Titel
Grapevine virus M, a novel vitivirus discovered in the American hybrid bunch grape cultivar Blanc du Bois in Texas
verfasst von
Olufemi J. Alabi
Sheila McBride
David N. Appel
Maher Al Rwahnih
Fran M. Pontasch
Publikationsdatum
15.04.2019
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 6/2019
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-019-04252-7

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