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Archives of Virology

Erschienen in:

01.06.2012 | Brief Report

Astrovirus in wild boars (Sus scrofa) in Hungary

verfasst von: Gábor Reuter, Csaba Nemes, Ákos Boros, Beatrix Kapusinszky, Eric Delwart, Péter Pankovics

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 6/2012

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Abstract

The family Astroviridae consists of two genera, Avastrovirus and Mamastrovirus whose members are associated with gastroenteritis in avian and mammalian hosts, respectively. In this study, we report the first detection of astrovirus from fecal specimens of wild boars (Sus scrofa) using viral metagenomics and complete genome sequencing. The wild boar astrovirus (WBAstV-1/2011/HUN, JQ340310) genome is 6707 nucleotide long and had 76%, 95% and 56% amino acid (aa) identity in the ORF1a (852aa), ORF1b (522aa) and ORF2 (845aa) regions, respectively, to porcine astrovirus 4 (PAstV-4, JF713713), the closest match. This study indicates that wild boar could be a reservoir for astroviruses.

Boros A, Pankovics P, Simmonds P, Reuter G (2011) Novel positive-sense, single-stranded RNA (+ssRNA) virus with di-cistronic genome from intestinal content of freshwater carp (Cyprinus carpio). PLoS One 6:e29145PubMedCrossRef

Chu DK, Poon LL, Guan Y, Peiris JS (2008) Novel astroviruses in insectivorous bats. J Virol 82:9107–9114PubMedCrossRef

Finkbeiner SR, Kirkwood CD, Wang D (2008) Complete genome sequence of a highly divergent astrovirus isolated from a child with acute diarrhea. Virol J 5:117PubMedCrossRef

Fu Y, Pan M, Wang X, Xu Y, Xie X, Knowles NJ, Yang H, Zhang D (2009) Complete sequence of a duck astrovirus associated with fatal hepatitis in ducklings. J Gen Virol 90:1104–1108PubMedCrossRef

Jonassen CM, Jonassen TO, Grinde B (1998) A common RNA motif in the 3′ end of the genomes of astroviruses, avian infectious bronchitis virus and an equine rhinovirus. J Gen Virol 79:715–718PubMed

Jonassen CM, Jonassen T, Saif Y, Snodgrass D, Ushijima H, Shimizu M, Grinde B (2001) Comparison of capsid sequences from human and animal astroviruses. J Gen Virol 82:1061–1067PubMed

Kapoor A, Li L, Victoria J, Oderinde B, Mason C, Pandey P, Zaidi SZ, Delwart E (2009) Multiple novel astrovirus species in human stool. J Gen Virol 90:2965–2972PubMedCrossRef

Kapoor A, Victoris J, Simmonds P, Slikas E, Chieochansin T, Naeem A, Shaukat S, Sharif S, Alam MM, Angez M, Wang C, Shafer RW, Zaidi S, Delwart E (2008) A highly prevalent and genetically diversified Picornaviridae genus in South Asian children. Proc Natl Acad Sci USA 105:20482–20487PubMedCrossRef

Li L, Shan T, Wang C, Côté C, Kolman J, Onions D, Gulland FMD, Delwart E (2011) The fecal viral flora of California sea lions. J Virol 85:9909–9917PubMedCrossRef

10.

Luo Z, Roi S, Dastor M, Gallice E, Laurin M-A, L’Homme Y (2011) Multiple novel and prevalent astroviruses in pigs. Vet Microbiol 149:316–323PubMedCrossRef

11.

Mendéz E, Arias CF (2007) Astroviruses. In: Knipe DM, Howley PM (eds) Fields virology, 5th edn. Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, pp 981–1000

12.

Nicholas KB, Nicholas HB Jr. (1997) GeneDoc: a tool for editing and annotating multiple sequence alignments. Distributed by the author. http://www.psc.edu/biomed/genedoc

13.

Reuter G, Pankovics P, Boros Á (2011) Identification of a novel astrovirus in a domestic pig in Hungary. Arch Virol 156:125–128PubMedCrossRef

14.

Reuter G, Pankovics P, Delwart E, Boros Á (2012) Identification of a novel species of astrovirus in domestic sheep in Hungary. Arch Virol 157:323–327. doi:10.1007/s00705-011-1151-4 PubMedCrossRef

15.

Shan T, Li L, Simmonds P, Wang C, Moeser A, Delwart E (2011) The fecal virome of pigs on a high-density farm. J Virol 85:11697–11708PubMedCrossRef

16.

Tamura K, Peterson D, Peterson N, Steche G, Nei M, Kumar S (2011) MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 28:2731–2739PubMedCrossRef

17.

van Hemert FJ, Lukashov VV, Berkhout B (2007) different rates of (non-)synonymous mutations in astrovirus genes; correlation with gene function. Virol J 4:25PubMedCrossRef

18.

Victoria JG, Kapoor A, Li L, Blinkova O, Slikas B, Wang C, Naeem A, Zaidi S, Delwart E (2009) Metagenomic analyses of viruses in stool samples from children with acute flaccid paralysis. J Virol 83:4642–4651PubMedCrossRef

19.

Zhu HC, Chu DK, Liu W, Dong BQ, Zhang SY, Zhang JX, Li LF, Vijaykrishna D, Smith GJ, Chen HL, Poon LLM, Peiris JSM, Guan Y (2009) Detection of diverse astroviruses from bats in China. J Gen Virol 90:883–887PubMedCrossRef

Titel: Astrovirus in wild boars (Sus scrofa) in Hungary
verfasst von: Gábor Reuter
Csaba Nemes
Ákos Boros
Beatrix Kapusinszky
Eric Delwart
Péter Pankovics
Publikationsdatum: 01.06.2012
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 6/2012
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-012-1272-4

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