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European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases

Erschienen in:

26.11.2016 | Original Article

MALDI-TOF MS meets WGS in a VRE outbreak investigation

verfasst von: S. Schlebusch, G. R. Price, R. L. Gallagher, V. Horton-Szar, L. D. H. Elbourne, P. Griffin, D. J. Venter, S. O. Jensen, S. J. Van Hal

Erschienen in: European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases | Ausgabe 3/2017

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Abstract

The use of MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption/ ionization–time of flight mass spectrometry) and WGS (whole genome sequencing) has been described for identification and strain relatedness determination. We describe the complementary use of MALDI-TOF MS and WGS in a VRE (vancomycin-resistant enterococci) outbreak investigation, and discuss some of the challenges with defining strain similarity across these two platforms. Although both assays indicated multiple clusters involved in the outbreak of vancomycin resistant Enterococcus faecium isolates from positive blood cultures of four haematology–oncology patients, the small cohort and discrepancies between findings indicate the limitations of MALDI-TOF MS and the cautious interpretation of MALDI-TOF MS dendrograms during outbreaks. For definitive determination of the evolutionary distance between isolates, WGS can be used.

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Titel: MALDI-TOF MS meets WGS in a VRE outbreak investigation
verfasst von: S. Schlebusch
G. R. Price
R. L. Gallagher
V. Horton-Szar
L. D. H. Elbourne
P. Griffin
D. J. Venter
S. O. Jensen
S. J. Van Hal
Publikationsdatum: 26.11.2016
Verlag: Springer Berlin Heidelberg
Erschienen in: European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases / Ausgabe 3/2017
Print ISSN: 0934-9723
Elektronische ISSN: 1435-4373
DOI: https://doi.org/10.1007/s10096-016-2824-4

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