Background
Results
Virus accession no.
| 1
| 2
| 3
| 4
| 5
| 6
| 7
| 8
| 9
| 10
| 11
| 12
| 13
| 14
| 15
| 16
| 17
| 18
| 19
| 20
| |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
FJ808074
| 97,9
| 97,5
| 97,7
| 97,7
| 98,9
| 96,7
| 97,5
| 94,7
| 83,1
| 97,5
| 97,7
| 97,7
| 97,5
| 97,3
| 97,3
| 97,3
| 97,7
| 95,5
| 97,9
| 1
| |
FJ665819
| 2,0
| 98,7
| 99,3
| 99,7
| 98,3
| 97,1
| 97,7
| 94,9
| 84,3
| 98,7
| 98,5
| 98,9
| 98,7
| 99,3
| 99,3
| 98,5
| 98,9
| 95,7
| 99,1
| 2
| |
FJ665818
| 2,4
| 1,2
| 98,9
| 98,9
| 97,9
| 96,9
| 97,7
| 94,1
| 83,7
| 99,5
| 99,3
| 99,7
| 99,5
| 98,5
| 98,5
| 99,3
| 99,7
| 94,9
| 98,7
| 3
| |
EU935106
| 2,2
| 0,6
| 1,0
| 99,1
| 98,1
| 96,9
| 97,5
| 94,3
| 83,9
| 98,9
| 98,7
| 99,1
| 98,9
| 99,1
| 99,1
| 98,7
| 99,1
| 95,1
| 99,3
| 4
| |
EU327506
| 2,2
| 0,2
| 1,0
| 0,8
| 98,1
| 96,9
| 97,9
| 94,7
| 84,3
| 98,9
| 98,7
| 99,1
| 98,9
| 99,1
| 99,1
| 98,7
| 99,1
| 95,5
| 98,9
| 5
| |
DQ263305
| 1,0
| 1,6
| 2,0
| 1,8
| 1,8
| 97,1
| 98,1
| 95,3
| 83,5
| 97,9
| 98,1
| 98,1
| 97,9
| 97,7
| 97,7
| 97,7
| 98,1
| 96,1
| 98,3
| 6
| |
DQ263303
| 3,3
| 2,9
| 3,1
| 3,1
| 3,1
| 2,9
| 96,1
| 93,7
| 82,1
| 96,7
| 96,9
| 96,9
| 96,7
| 96,9
| 97,1
| 96,5
| 96,9
| 94,5
| 97,1
| 7
| |
AY958203
| 2,4
| 2,2
| 2,2
| 2,4
| 2,0
| 1,8
| 3,9
| 94,7
| 83,1
| 97,9
| 98,1
| 97,9
| 97,7
| 97,1
| 97,1
| 97,5
| 97,9
| 95,5
| 97,7
| 8
| |
AY453656
| 5,4
| 5,2
| 6,1
| 5,8
| 5,4
| 4,8
| 6,5
| 5,4
| 83,1
| 94,1
| 94,3
| 94,3
| 94,1
| 94,3
| 94,3
| 93,9
| 94,3
| 98,7
| 94,5
| 9
| |
AY424973
| 19,1
| 17,6
| 18,3
| 18,1
| 17,6
| 18,6
| 20,4
| 19,1
| 19,1
| 83,9
| 83,7
| 83,9
| 83,7
| 83,7
| 83,7
| 83,7
| 83,9
| 83,7
| 83,7
| 10
| |
AY386263
| 2,4
| 1,2
| 0,4
| 1,0
| 1,0
| 2,0
| 3,3
| 2,0
| 6,1
| 18,1
| 99,7
| 99,7
| 99,5
| 98,5
| 98,5
| 99,3
| 99,7
| 94,9
| 98,7
| 11
| |
AY278209
| 2,2
| 1,4
| 0,6
| 1,2
| 1,2
| 1,8
| 3,1
| 1,8
| 5,8
| 18,3
| 0,2
| 99,5
| 99,3
| 98,3
| 98,3
| 99,1
| 99,5
| 95,1
| 98,5
| 12
| |
AB521175
| 2,2
| 1,0
| 0,2
| 0,8
| 0,8
| 1,8
| 3,1
| 2,0
| 5,8
| 18,1
| 0,2
| 0,4
| 99,7
| 98,7
| 98,7
| 99,5
| 100
| 95,1
| 98,9
| 13
| |
AB189670
| 2,4
| 1,2
| 0,4
| 1,0
| 1,0
| 2,0
| 3,3
| 2,2
| 6,1
| 18,3
| 0,4
| 0,6
| 0,2
| 98,5
| 98,5
| 99,3
| 99,7
| 94,9
| 98,7
| 14
| |
GU320351
| 2,7
| 0,6
| 1,4
| 0,8
| 0,8
| 2,2
| 3,1
| 2,9
| 5,8
| 18,3
| 1,4
| 1,6
| 1,2
| 1,4
| 99,1
| 98,3
| 98,7
| 95,1
| 98,9
| 15
| |
HQ215588
| 2,7
| 0,6
| 1,4
| 0,8
| 0,8
| 2,2
| 2,9
| 2,9
| 5,8
| 18,3
| 1,4
| 1,6
| 1,2
| 1,4
| 0,8
| 98,3
| 98,7
| 95,1
| 98,9
| 16
| |
HQ215589
| 2,7
| 1,4
| 0,6
| 1,2
| 1,2
| 2,2
| 3,5
| 2,4
| 6,3
| 18,3
| 0,6
| 0,8
| 0,4
| 0,6
| 1,6
| 1,6
| 99,5
| 94,7
| 98,5
| 17
| |
AY453667
| 2,2
| 1,0
| 0,2
| 0,8
| 0,8
| 1,8
| 3,1
| 2,0
| 5,8
| 18,1
| 0,2
| 0,4
| 0,0
| 0,2
| 1,2
| 1,2
| 0,4
| 95,1
| 98,9
| 18
| |
AY424972
| 4,6
| 4,3
| 5,2
| 5,0
| 4,6
| 3,9
| 2,6
| 4,6
| 1,2
| 18,3
| 5,2
| 5,0
| 5,0
| 5,2
| 5,0
| 5,0
| 5,4
| 5,0
| 95,3
| 19
| |
AY453654
| 2,0
| 0,8
| 1,2
| 0,6
| 1,0
| 1,6
| 2,9
| 2,2
| 5,6
| 18,3
| 1,2
| 1,4
| 1,0
| 1,2
| 1,0
| 1,0
| 1,5
| 1,0
| 4,8
| 20
|
Discussion
Conclusion
Methods
Virus | Species affected | Accession number | Country of isolation |
---|---|---|---|
Jilin | Sheep | FJ808074 | China |
NE1 | Goat | FJ665819 | Brazil |
MT05 | Sheep | FJ665818 | Brazil |
Hoping | Goat | EU935106 | Taiwan |
Taiping | Goat | EU327506 | Taiwan |
67/04 | Sheep | DQ263305 | India |
82/04 | Goat | DQ263303 | India |
- | - | AY958203 | Iran |
F00.120R | Reindeer | AY453656 | Finland |
Bovine papular stomatitis | Calf | AY424973 | - |
OV-IA82 | Lamb | AY386263 | USA |
Vaccine strain | Goat | AY278209 | USA |
Ena | Serow | AB521175 | Japan |
HIS | Sheep | AB189670 | Japan |
HuB/2009 | - | GU320351 | China |
Cro-Goat-11727/10 | Goat | HQ215588 | Croatia |
Cro-Cres-12446/09 | Sheep | HQ215589 | Croatia |
NZ2 | Sheep | AY453667 | New Zealand |
Tillquist Pseudocowpox | Cow | AY424972 | - |
D1701 | Reindeer | AY453654 | Finland |