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Erschienen in: Archives of Virology 11/2019

07.09.2019 | Annotated Sequence Record

Penguin megrivirus, a novel picornavirus from an Adélie penguin (Pygoscelis adeliae)

verfasst von: C. K. Yinda, J. Esefeld, H. U. Peter, J. Matthijnssens, R. Zell

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 11/2019

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Abstract

The complete genome sequence of a novel megrivirus of the family Picornaviridae was determined from nucleic acid extracted from a pool of six faecal specimens of Adélie penguins. The samples were collected near Bellingshausen Station, King George Island of the South Shetland Islands, Antarctica. Penguin megrivirus is the first megrivirus with a predicted L protein. It has an L-3-5-4 genome layout, a type IV IRES, and a long 3’ untranslated region of 668 nt.
Literatur
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Zurück zum Zitat Zell R, Delwart E, Gorbalenya AE, Hovi T, King AMQ, Knowles NJ, Lindberg AM, Pallansch MA, Palmenberg AC, Reuter G, Simmonds P, Skern T, Stanway G, Yamashita T, ICTV Report Consortium (2017) ICTV virus taxonomy profile: Picornaviridae. J Gen Virol 98:2421–2422CrossRefPubMedPubMedCentral Zell R, Delwart E, Gorbalenya AE, Hovi T, King AMQ, Knowles NJ, Lindberg AM, Pallansch MA, Palmenberg AC, Reuter G, Simmonds P, Skern T, Stanway G, Yamashita T, ICTV Report Consortium (2017) ICTV virus taxonomy profile: Picornaviridae. J Gen Virol 98:2421–2422CrossRefPubMedPubMedCentral
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Zurück zum Zitat Conceicao-Neto N, Zeller M, Lefrere H, De Bruyn P, Beller L, Deboutte W, Yinda CK, Lavigne R, Maes P, Van Ranst M, Heylen E, Matthijnssens J (2015) Modular approach to customise sample preparation procedures for viral metagenomics: a reproducible protocol for virome analysis. Sci Rep 5:16532CrossRefPubMedPubMedCentral Conceicao-Neto N, Zeller M, Lefrere H, De Bruyn P, Beller L, Deboutte W, Yinda CK, Lavigne R, Maes P, Van Ranst M, Heylen E, Matthijnssens J (2015) Modular approach to customise sample preparation procedures for viral metagenomics: a reproducible protocol for virome analysis. Sci Rep 5:16532CrossRefPubMedPubMedCentral
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Zurück zum Zitat Yinda CK, Zeller M, Conceicao-Neto N, Maes P, Deboutte W, Beller L, Heylen E, Ghogomu SM, Van Ranst M, Matthijnssens J (2016) Novel highly divergent reassortant bat rotaviruses in Cameroon, without evidence of zoonosis. Sci Rep 6:34209CrossRefPubMedPubMedCentral Yinda CK, Zeller M, Conceicao-Neto N, Maes P, Deboutte W, Beller L, Heylen E, Ghogomu SM, Van Ranst M, Matthijnssens J (2016) Novel highly divergent reassortant bat rotaviruses in Cameroon, without evidence of zoonosis. Sci Rep 6:34209CrossRefPubMedPubMedCentral
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Zurück zum Zitat Wang F, Liang T, Liu N, Ning K, Yu K, Zhang D (2017) Genetic characterization of two novel megriviruses in geese. J Gen Virol 98:607–611CrossRefPubMed Wang F, Liang T, Liu N, Ning K, Yu K, Zhang D (2017) Genetic characterization of two novel megriviruses in geese. J Gen Virol 98:607–611CrossRefPubMed
Metadaten
Titel
Penguin megrivirus, a novel picornavirus from an Adélie penguin (Pygoscelis adeliae)
verfasst von
C. K. Yinda
J. Esefeld
H. U. Peter
J. Matthijnssens
R. Zell
Publikationsdatum
07.09.2019
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 11/2019
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-019-04404-9

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