Skip to main content
Erschienen in: Archives of Virology 8/2019

20.05.2019 | Annotated Sequence Record

A novel bat-associated circovirus identified in northern Hokkaido, Japan

verfasst von: Takashi Matsumoto, Masahiko Sato, Akira Nishizono, Kamruddin Ahmed

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 8/2019

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

We identified two novel circoviruses, HK02976 and HK00220, in oral swabs from bats. The size of their full genome was 2,010 nucleotides (nt). The full-genome sequence of our strains shared 96.1% nucleotide sequence identity with each other, and 39.9%–69.5% identity with bat-associated circoviruses (BatACVs)1–9. Based on the species demarcation threshold for viruses of the family Circoviridae, which is 80% genome-wide nucleotide sequence identity, we have tentatively named this group of viruses “bat-associated circovirus 10” (BatACV10).
Anhänge
Nur mit Berechtigung zugänglich
Literatur
1.
Zurück zum Zitat Breitbart M, Delwart E, Rosario K, Segales J, Varsani A, Ictv Report C (2017) ICTV virus taxonomy profile: Circoviridae. J Gen Virol 98:1997–1998CrossRefPubMedPubMedCentral Breitbart M, Delwart E, Rosario K, Segales J, Varsani A, Ictv Report C (2017) ICTV virus taxonomy profile: Circoviridae. J Gen Virol 98:1997–1998CrossRefPubMedPubMedCentral
2.
Zurück zum Zitat He B, Li Z, Yang F, Zheng J, Feng Y, Guo H, Li Y, Wang Y, Su N, Zhang F, Fan Q, Tu C (2013) Virome profiling of bats from Myanmar by metagenomic analysis of tissue samples reveals more novel Mammalian viruses. PLoS One 8:e61950CrossRefPubMedPubMedCentral He B, Li Z, Yang F, Zheng J, Feng Y, Guo H, Li Y, Wang Y, Su N, Zhang F, Fan Q, Tu C (2013) Virome profiling of bats from Myanmar by metagenomic analysis of tissue samples reveals more novel Mammalian viruses. PLoS One 8:e61950CrossRefPubMedPubMedCentral
3.
Zurück zum Zitat Li L, Kapoor A, Slikas B, Bamidele OS, Wang C, Shaukat S, Masroor MA, Wilson ML, Ndjango JB, Peeters M, Gross-Camp ND, Muller MN, Hahn BH, Wolfe ND, Triki H, Bartkus J, Zaidi SZ, Delwart E (2010) Multiple diverse circoviruses infect farm animals and are commonly found in human and chimpanzee feces. J Virol 84:1674–1682CrossRefPubMed Li L, Kapoor A, Slikas B, Bamidele OS, Wang C, Shaukat S, Masroor MA, Wilson ML, Ndjango JB, Peeters M, Gross-Camp ND, Muller MN, Hahn BH, Wolfe ND, Triki H, Bartkus J, Zaidi SZ, Delwart E (2010) Multiple diverse circoviruses infect farm animals and are commonly found in human and chimpanzee feces. J Virol 84:1674–1682CrossRefPubMed
4.
Zurück zum Zitat Rosario K, Breitbart M, Harrach B, Segales J, Delwart E, Biagini P, Varsani A (2017) Revisiting the taxonomy of the family Circoviridae: establishment of the genus Cyclovirus and removal of the genus Gyrovirus. Arch Virol 162:1447–1463CrossRefPubMed Rosario K, Breitbart M, Harrach B, Segales J, Delwart E, Biagini P, Varsani A (2017) Revisiting the taxonomy of the family Circoviridae: establishment of the genus Cyclovirus and removal of the genus Gyrovirus. Arch Virol 162:1447–1463CrossRefPubMed
5.
Zurück zum Zitat Todd D, Weston J, Ball NW, Borghmans BJ, Smyth JA, Gelmini L, Lavazza A (2001) Nucleotide sequence-based identification of a novel circovirus of canaries. Avian Pathol 30:321–325CrossRefPubMed Todd D, Weston J, Ball NW, Borghmans BJ, Smyth JA, Gelmini L, Lavazza A (2001) Nucleotide sequence-based identification of a novel circovirus of canaries. Avian Pathol 30:321–325CrossRefPubMed
6.
Zurück zum Zitat Wu Z, Yang L, Ren X, He G, Zhang J, Yang J, Qian Z, Dong J, Sun L, Zhu Y, Du J, Yang F, Zhang S, Jin Q (2016) Deciphering the bat virome catalog to better understand the ecological diversity of bat viruses and the bat origin of emerging infectious diseases. ISME J 10:609–620CrossRefPubMed Wu Z, Yang L, Ren X, He G, Zhang J, Yang J, Qian Z, Dong J, Sun L, Zhu Y, Du J, Yang F, Zhang S, Jin Q (2016) Deciphering the bat virome catalog to better understand the ecological diversity of bat viruses and the bat origin of emerging infectious diseases. ISME J 10:609–620CrossRefPubMed
Metadaten
Titel
A novel bat-associated circovirus identified in northern Hokkaido, Japan
verfasst von
Takashi Matsumoto
Masahiko Sato
Akira Nishizono
Kamruddin Ahmed
Publikationsdatum
20.05.2019
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 8/2019
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-019-04286-x

Weitere Artikel der Ausgabe 8/2019

Archives of Virology 8/2019 Zur Ausgabe

Leitlinien kompakt für die Innere Medizin

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag

Echinokokkose medikamentös behandeln oder operieren?

06.05.2024 DCK 2024 Kongressbericht

Die Therapie von Echinokokkosen sollte immer in spezialisierten Zentren erfolgen. Eine symptomlose Echinokokkose kann – egal ob von Hunde- oder Fuchsbandwurm ausgelöst – konservativ erfolgen. Wenn eine Op. nötig ist, kann es sinnvoll sein, vorher Zysten zu leeren und zu desinfizieren. 

Umsetzung der POMGAT-Leitlinie läuft

03.05.2024 DCK 2024 Kongressbericht

Seit November 2023 gibt es evidenzbasierte Empfehlungen zum perioperativen Management bei gastrointestinalen Tumoren (POMGAT) auf S3-Niveau. Vieles wird schon entsprechend der Empfehlungen durchgeführt. Wo es im Alltag noch hapert, zeigt eine Umfrage in einem Klinikverbund.

Proximale Humerusfraktur: Auch 100-Jährige operieren?

01.05.2024 DCK 2024 Kongressbericht

Mit dem demographischen Wandel versorgt auch die Chirurgie immer mehr betagte Menschen. Von Entwicklungen wie Fast-Track können auch ältere Menschen profitieren und bei proximaler Humerusfraktur können selbst manche 100-Jährige noch sicher operiert werden.

Die „Zehn Gebote“ des Endokarditis-Managements

30.04.2024 Endokarditis Leitlinie kompakt

Worauf kommt es beim Management von Personen mit infektiöser Endokarditis an? Eine Kardiologin und ein Kardiologe fassen die zehn wichtigsten Punkte der neuen ESC-Leitlinie zusammen.

Update Innere Medizin

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.