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Erschienen in: Archives of Virology 9/2012

01.09.2012 | Annotated Sequence Record

Complete genome sequence of narcissus late season yellows virus infecting Chinese narcissus in China

verfasst von: Shuang-Qing Lin, Jian-Guo Shen, Fang-Luan Gao, Wei Cai, Zhen Huang, Li-Yan Xie, Zu-Jian Wu

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 9/2012

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Abstract

The complete genome sequence of a Chinese narcissus isolate of narcissus late season yellows virus from Zhangzhou, China (NLSYV-ZZ), was determined to be 9,651 nucleotides in length, excluding the 3′-terminal poly (A) tail, by amplification and sequencing of virus RNA. The viral genome contains a single long open reading frame of 9,315 nucleotides encoding a polyprotein of 3,105 amino acids. The polyprotein was predicted to be cleaved into ten mature proteins by three viral proteases. Complete genome sequence comparison and phylogenetic analysis indicated that NLSYV-ZZ was most closely related to narcissus yellow stripe virus (NYSV), which was also isolated from narcissus. These viruses shared 69.9 % identity in their complete nucleotide sequences and 77.0 % identity in their polyprotein amino acid sequences.
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Metadaten
Titel
Complete genome sequence of narcissus late season yellows virus infecting Chinese narcissus in China
verfasst von
Shuang-Qing Lin
Jian-Guo Shen
Fang-Luan Gao
Wei Cai
Zhen Huang
Li-Yan Xie
Zu-Jian Wu
Publikationsdatum
01.09.2012
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 9/2012
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-012-1328-5

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