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Erschienen in:

21.03.2016 | Annotated Sequence Record

Complete genome sequence of Xishuangbanna flavivirus, a novel mosquito-specific flavivirus from China

verfasst von: Hang Fan, Qiumin Zhao, Xiaofang Guo, Qiang Sun, Shuqing Zuo, Chao Wu, Hongning Zhou, Xiaoping An, Guangqian Pei, Yigang Tong, Jiusong Zhang, Taoxing Shi

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 6/2016

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Abstract

A new flavivirus, Xishuangbanna flavivirus (XFV), infecting Aedes albopictus mosquitoes in Yunnan Province, China, was isolated and sequenced. The single-stranded RNA genome of 10,884 nt contained two open reading frames (ORFs) encoding the polyprotein and FIFO. The genome had a maximum nucleotide sequence identity of 65 % to Parramatta River virus with coverage of only 27 %. Phylogenetic analysis suggested that this virus is most closely related to recognized classical insect-specific flaviviruses (cISF) and most likely has a similar host range. Sequence comparisons and phylogenetic analysis demonstrated that XFV is a new member of the genus Flavivirus.

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Titel: Complete genome sequence of Xishuangbanna flavivirus, a novel mosquito-specific flavivirus from China
verfasst von: Hang Fan
Qiumin Zhao
Xiaofang Guo
Qiang Sun
Shuqing Zuo
Chao Wu
Hongning Zhou
Xiaoping An
Guangqian Pei
Yigang Tong
Jiusong Zhang
Taoxing Shi
Publikationsdatum: 21.03.2016
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 6/2016
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-016-2827-6

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