Skip to main content
Erschienen in: Archives of Virology 1/2018

22.09.2017 | Brief Report

Dicipivirus (family Picornaviridae) in wild Northern white-breasted hedgehog (Erinaceus roumanicus)

verfasst von: Gábor Reuter, Ákos Boros, Gábor Földvári, Sándor Szekeres, Róbert Mátics, Beatrix Kapusinszky, Eric Delwart, Péter Pankovics

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 1/2018

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

Using random amplification and high-throughput sequencing technology a novel picornavirus with dicistronic genome organization and genetically related to canine picodicistrovirus (genus Dicipivirus, family Picornaviridae) was identified and characterized in Northern white-breasted hedgehogs. Hedgehog dicipivirus (hedgehog/H14/2015/HUN, MF188967) was detected in 15 (75%) of 20 faecal specimens by RT-PCR with high viral loads (up to 8.2x108 genomic copies/ml faeces). Hedgehog dicipivirus RNA was also identified in blood, ear skin, abdominal muscle and liver tissues. While the general dicistronic genome organization of hedgehog/H14/2015/HUN is similar to canine picodicistrovirus (5’UTR-P1-IGR-P2/P3-3UTR) there are some unique genome characteristics within the untranslated regions, especially in the functional IRES elements. This study reports the putative second member of the genus Dicipivirus, in a novel host species.
Literatur
2.
Zurück zum Zitat Knowles NJ, Hovi T, Hyypiä T, King AMQ, Lindberg AM, Pallansch MA, Palmenberg AC, Simmonds P, Skern T, Stanway G, Yamashita T, Zell R (2012) Picornaviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: ninth report of the international committee on taxonomy of viruses. Elsevier, San Diego, pp 855–880 Knowles NJ, Hovi T, Hyypiä T, King AMQ, Lindberg AM, Pallansch MA, Palmenberg AC, Simmonds P, Skern T, Stanway G, Yamashita T, Zell R (2012) Picornaviridae. In: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: ninth report of the international committee on taxonomy of viruses. Elsevier, San Diego, pp 855–880
3.
Zurück zum Zitat Woo PC, Lau SK, Choi GK, Huang Y, Teng JL, Tsoi HW, Tse H, Yeung ML, Chan KH, Jin DY, Yuen KY (2012) Natural occurrence and characterization of two internal ribosome entry site elements in a novel virus, canine picodicistrovirus, in the picornavirus-like superfamily. J Virol 86:2797–2808CrossRefPubMedPubMedCentral Woo PC, Lau SK, Choi GK, Huang Y, Teng JL, Tsoi HW, Tse H, Yeung ML, Chan KH, Jin DY, Yuen KY (2012) Natural occurrence and characterization of two internal ribosome entry site elements in a novel virus, canine picodicistrovirus, in the picornavirus-like superfamily. J Virol 86:2797–2808CrossRefPubMedPubMedCentral
4.
Zurück zum Zitat Lapini L (1999) Erinaceus concolor. In: Mitchell-Jones AJ, Amori G, Bogdanowicz W, Kryštufek B, Reijnders PJH, Spitzenberger F, Stubbe M, Thissen JBM, Vohralík V, Zima J (eds) The atlas of European mammals. Academic Press, London, pp 36–37 Lapini L (1999) Erinaceus concolor. In: Mitchell-Jones AJ, Amori G, Bogdanowicz W, Kryštufek B, Reijnders PJH, Spitzenberger F, Stubbe M, Thissen JBM, Vohralík V, Zima J (eds) The atlas of European mammals. Academic Press, London, pp 36–37
5.
Zurück zum Zitat Szekeres S, Majláthová V, Majláth I, Földvári G (2016) Neglected hosts: the role of lacertid lizards and medium-sized mammals in the eco-epidemiology of Lyme borreliosis. In: Braks MAH, van Wieren SE, Takken W, Sprong H (eds) Ecology and prevention of Lyme borreliosis (ecology and control of vector-borne diseases, volume 4). Wageningen Academic Publishers, Wageningen, pp 103–126 Szekeres S, Majláthová V, Majláth I, Földvári G (2016) Neglected hosts: the role of lacertid lizards and medium-sized mammals in the eco-epidemiology of Lyme borreliosis. In: Braks MAH, van Wieren SE, Takken W, Sprong H (eds) Ecology and prevention of Lyme borreliosis (ecology and control of vector-borne diseases, volume 4). Wageningen Academic Publishers, Wageningen, pp 103–126
6.
Zurück zum Zitat Phan TG, Vo NP, Boros Á, Pankovics P, Reuter G, Li OT, Wang C, Deng X, Poon LL, Delwart E (2013) The viruses of wild pigeon droppings. PLoS One. 8:e72787CrossRefPubMedPubMedCentral Phan TG, Vo NP, Boros Á, Pankovics P, Reuter G, Li OT, Wang C, Deng X, Poon LL, Delwart E (2013) The viruses of wild pigeon droppings. PLoS One. 8:e72787CrossRefPubMedPubMedCentral
7.
Zurück zum Zitat Victoria JG, Kapoor A, Li L, Blinkova O, Slikas B, Wang C, Naeem A, Zaidi S, Delwart E (2009) Metagenomic analyses of viruses in stool samples from children with acute flaccid paralysis. J Virol 83:4642–4651CrossRefPubMedPubMedCentral Victoria JG, Kapoor A, Li L, Blinkova O, Slikas B, Wang C, Naeem A, Zaidi S, Delwart E (2009) Metagenomic analyses of viruses in stool samples from children with acute flaccid paralysis. J Virol 83:4642–4651CrossRefPubMedPubMedCentral
8.
Zurück zum Zitat Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S (2013) MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 30:2725–2729CrossRefPubMedPubMedCentral Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S (2013) MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Mol Biol Evol 30:2725–2729CrossRefPubMedPubMedCentral
9.
Zurück zum Zitat Zucker M (2003) Mfold web server for nucleic acid folding and hybridization prediction. Nucleic Acids Res 31:3406–3415CrossRef Zucker M (2003) Mfold web server for nucleic acid folding and hybridization prediction. Nucleic Acids Res 31:3406–3415CrossRef
10.
Zurück zum Zitat Asnani M, Pestova TV, Hellen CUT (2016) Initiation on the divergent type I cadicivirus IRES: factor requirements and interactions with the translation apparatus. Nucleic Acids Res 44:3390–3407CrossRefPubMedPubMedCentral Asnani M, Pestova TV, Hellen CUT (2016) Initiation on the divergent type I cadicivirus IRES: factor requirements and interactions with the translation apparatus. Nucleic Acids Res 44:3390–3407CrossRefPubMedPubMedCentral
11.
Zurück zum Zitat Asnani M, Pestova TV, Hellen CUT (2016) PCBP2 enables the cadicivirus IRES to exploit the function of a conserved GRNA tetraloop to enhance ribosomal initiation complex formation. Nucleic Acids Res 44:9902–9917CrossRefPubMedPubMedCentral Asnani M, Pestova TV, Hellen CUT (2016) PCBP2 enables the cadicivirus IRES to exploit the function of a conserved GRNA tetraloop to enhance ribosomal initiation complex formation. Nucleic Acids Res 44:9902–9917CrossRefPubMedPubMedCentral
13.
Zurück zum Zitat Drexler JF, Corman VM, Lukashev AN, van den Brand J, Gmyl AP, Brünink S, Rasche A, Seggwiβ Feng H, Leijten LM, Vallo P, Kuiken T, Dotzauer A, Ulrich RG, Lemon SM, Drosten C (2015) Evolutionary origins of hepatitis A virus in small mammals. PNAS 112:15190–15195CrossRefPubMedPubMedCentral Drexler JF, Corman VM, Lukashev AN, van den Brand J, Gmyl AP, Brünink S, Rasche A, Seggwiβ Feng H, Leijten LM, Vallo P, Kuiken T, Dotzauer A, Ulrich RG, Lemon SM, Drosten C (2015) Evolutionary origins of hepatitis A virus in small mammals. PNAS 112:15190–15195CrossRefPubMedPubMedCentral
Metadaten
Titel
Dicipivirus (family Picornaviridae) in wild Northern white-breasted hedgehog (Erinaceus roumanicus)
verfasst von
Gábor Reuter
Ákos Boros
Gábor Földvári
Sándor Szekeres
Róbert Mátics
Beatrix Kapusinszky
Eric Delwart
Péter Pankovics
Publikationsdatum
22.09.2017
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 1/2018
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-017-3565-0

Weitere Artikel der Ausgabe 1/2018

Archives of Virology 1/2018 Zur Ausgabe

Leitlinien kompakt für die Innere Medizin

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag

Erhebliches Risiko für Kehlkopfkrebs bei mäßiger Dysplasie

29.05.2024 Larynxkarzinom Nachrichten

Fast ein Viertel der Personen mit mäßig dysplastischen Stimmlippenläsionen entwickelt einen Kehlkopftumor. Solche Personen benötigen daher eine besonders enge ärztliche Überwachung.

Nach Herzinfarkt mit Typ-1-Diabetes schlechtere Karten als mit Typ 2?

29.05.2024 Herzinfarkt Nachrichten

Bei Menschen mit Typ-2-Diabetes sind die Chancen, einen Myokardinfarkt zu überleben, in den letzten 15 Jahren deutlich gestiegen – nicht jedoch bei Betroffenen mit Typ 1.

15% bedauern gewählte Blasenkrebs-Therapie

29.05.2024 Urothelkarzinom Nachrichten

Ob Patienten und Patientinnen mit neu diagnostiziertem Blasenkrebs ein Jahr später Bedauern über die Therapieentscheidung empfinden, wird einer Studie aus England zufolge von der Radikalität und dem Erfolg des Eingriffs beeinflusst.

Costims – das nächste heiße Ding in der Krebstherapie?

28.05.2024 Onkologische Immuntherapie Nachrichten

„Kalte“ Tumoren werden heiß – CD28-kostimulatorische Antikörper sollen dies ermöglichen. Am besten könnten diese in Kombination mit BiTEs und Checkpointhemmern wirken. Erste klinische Studien laufen bereits.

Update Innere Medizin

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.