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23.11.2016 | Original Article | Ausgabe 3/2017 Open Access

Archives of Virology 3/2017

Evolution of DS-1-like G1P[8] double-gene reassortant rotavirus A strains causing gastroenteritis in children in Vietnam in 2012/2013

Zeitschrift:
Archives of Virology > Ausgabe 3/2017
Autoren:
Toyoko Nakagomi, Minh Quang Nguyen, Punita Gauchan, Chantal Ama Agbemabiese, Miho Kaneko, Loan Phuong Do, Thiem Dinh Vu, Osamu Nakagomi
Wichtige Hinweise

Electronic supplementary material

The online version of this article (doi:10.​1007/​s00705-016-3155-6) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Abstract

Rotavirus A (RVA) strains, a leading cause of severe gastroenteritis in children worldwide, commonly possess the Wa or DS-1 genotype constellations. During a hospital-based study conducted in Hanoi, Vietnam, in the 2012-2013 rotavirus season, G1P[8] strains with a virtually identical short RNA migration pattern were detected in 20 (14%) of 141 rotavirus-positive samples. Two representatives of these strains were shown by whole-genome sequencing to be double-gene reassortants possessing the genotype constellation of G1-P[8]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2. Sequencing and a database search revealed that these Vietnamese G1P[8] double-gene reassortant strains shared an immediate ancestor with a locally circulating G2P[4] strain in all of the inner-capsid and non-structural protein genes, whereas they were more closely related in the VP7 and VP4 genes to a Chinese G1P[8] strain and a Chinese G3P[8] strain, respectively, than to locally circulating G1P[8] strains. Despite the marked similarity between Japanese and Thai G1P[8] double-gene reassortant strains, phylogenetic analysis suggested that the Vietnamese and Japanese/Thai G1P[8] double-gene reassortant strains originated from independent reassortment events. Clinically, children infected with Vietnamese G1P[8] double-gene reassortant strains experienced severe diarrhoea, but it was not more severe than that in children infected with ordinary G1P[8] strains. In conclusion, Vietnamese G1P[8] double-gene reassortant strains originated from a locally circulating G2P[4] strain and caused severe diarrhoea, but there was no evidence of increased virulence.

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Literatur
Über diesen Artikel

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