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Archives of Virology
Erschienen in: Archives of Virology 2/2022

28.01.2022 | Annotated Sequence Record

Identification of a novel alphaendornavirus from Lonicera maackii

verfasst von: Zheng Dong, Hang Yin, Xulong Wang, Shuhao Lu, Wenjie Zuo, Zhibin Liu, Yongqiang Li

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 2/2022

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Abstract

A new alphaendornavirus, tentatively named “Lonicera maackii alphaendornavirus” (LmEV), was identified in a Lonicera maackii plant in Beijing, China, with leaf abnormality of interveinal chlorosis, and its complete genome sequence was determined using small-RNA deep sequencing. The RNA genome of LmEV is 16,176 nt in length and contains a large open reading frame encoding a polyprotein of 5363 aa with conserved domains including a cysteine-rich region, a viral helicase, and an RNA-dependent RNA polymerase. Sequence comparisons showed that LmEV shared the highest nt and aa sequence identity with Vicia faba alphaendornavirus (VfEV) of the genus Alphaendornavirus. In phylogenetic analysis of the RdRp aa sequence LmEV clustered with members of the genus Alphaendornavirus, closest to VfEV. To our knowledge, this is the first report of a novel alphaendornavirus identified in Lonicera maackii. Its effect on the host plant, if any, remains to be investigated.
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Metadaten
Titel
Identification of a novel alphaendornavirus from Lonicera maackii
verfasst von
Zheng Dong
Hang Yin
Xulong Wang
Shuhao Lu
Wenjie Zuo
Zhibin Liu
Yongqiang Li
Publikationsdatum
28.01.2022
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 2/2022
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-021-05347-w

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