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Archives of Virology

Erschienen in:

26.12.2017 | Annotated Sequence Record

Virome analysis of lily plants reveals a new potyvirus

verfasst von: Yongqiang Li, Anning Jia, Yan Qiao, Jun Xiang, Yongjiang Zhang, Wenhe Wang

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 4/2018

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Abstract

Lily plants exhibiting virus-like symptoms of leaf yellowing, twisting and brownish necrotic spots were collected, and next-generation sequencing of small RNAs was conducted to identify the associated viruses. Cucumber mosaic virus, lily symptomless virus and a hitherto unrecorded potyvirus, tentatively named “lily yellow mosaic virus” (LYMV), were detected. The genomic RNA of LYMV was 9811 nt in length, encoding a large polyprotein of 3,124 amino acids with a predicted M_r of 353.3 kDa. BLAST analysis showed that LYMV shared a high degree of amino acid sequence identity with Thunberg fritillary mosaic virus (55%), bean yellow mosaic virus (52%), clover yellow vein virus (51%), leek yellow stripe virus (51%), and lily mottle virus (52%), and these viruses clustered together in a phylogenetic tree.

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Titel: Virome analysis of lily plants reveals a new potyvirus
verfasst von: Yongqiang Li
Anning Jia
Yan Qiao
Jun Xiang
Yongjiang Zhang
Wenhe Wang
Publikationsdatum: 26.12.2017
Verlag: Springer Vienna
Erschienen in: Archives of Virology / Ausgabe 4/2018
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-017-3690-9

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