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Erschienen in: Archives of Virology 3/2021

07.01.2021 | Annotated Sequence Record

A new virus of the family Tombusviridae infecting sugarcane

verfasst von: Muhammad N. Tahir, Stephen Bolus, Samuel C. Grinstead, Sharon A. McFarlane, Dimitre Mollov

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 3/2021

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Abstract

Many viral diseases of sugarcane negatively affect yield. A sugarcane accession originating from South Africa exhibiting mosaic symptoms was processed for high-throughput sequencing. Bioinformatic analysis revealed two known sugarcane viruses and a contig of around 2,800 nucleotides resembling umbra-like viruses of the family Tombusviridae. The sequence of the viral contig was confirmed by cloning and Sanger sequencing, and the ends of the virus sequence were determined. Open reading frame analysis revealed the presence of four ORFs. Phylogenetic analysis of the complete virus sequence showed that this virus clusters with other umbra-like viruses of the family Tombusviridae.
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Metadaten
Titel
A new virus of the family Tombusviridae infecting sugarcane
verfasst von
Muhammad N. Tahir
Stephen Bolus
Samuel C. Grinstead
Sharon A. McFarlane
Dimitre Mollov
Publikationsdatum
07.01.2021
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 3/2021
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-020-04908-9

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