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Erschienen in: Archives of Virology 2/2022

11.01.2022 | Annotated Sequence Record

Molecular characterization of a novel fusagravirus in the phytopathogenic fungus Streptobotrys caulophylli

verfasst von: Siryuyumunsi Daniel, Assane Hamidou Abdoulaye, Yue Deng, Mingde Wu, Jing Zhang, Guoqing Li

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 2/2022

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Abstract

Streptobotrys caulophylli is a pathogenic fungus that causes leaf and stem blight in many plants. We report a novel fusagravirus identified in S. caulophylli strain STB-2, provisionally named "Streptobotrys caulophylli fusagravirus 1" (ScFV1). The full-length genome of ScFV1 is 9270 nucleotides (nt) long and putatively possesses two large open reading frames (ORF1 and ORF2), which are separated by an intergenic region of 955 nt. A conserved domain search revealed that ORF2 (1051 aa) encodes a putative RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), whereas ORF1 (1404 aa) encodes a protein of unknown function. Homology searches and phylogenetic analysis of the putative RdRp suggest that ScFV1 is a new member of the proposed family “Fusagraviridae”. This is the first report of a mycovirus infecting the fungus S. caulophylli.
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Literatur
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Metadaten
Titel
Molecular characterization of a novel fusagravirus in the phytopathogenic fungus Streptobotrys caulophylli
verfasst von
Siryuyumunsi Daniel
Assane Hamidou Abdoulaye
Yue Deng
Mingde Wu
Jing Zhang
Guoqing Li
Publikationsdatum
11.01.2022
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 2/2022
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-021-05328-z

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