Skip to main content
Erschienen in: International Journal of Legal Medicine 6/2020

09.09.2020 | Original Article

Novel insights into wound age estimation: combined with “up, no change, or down” system and cosine similarity in python environment

verfasst von: Li-hong Dang, Na Feng, Guo-shuai An, Jie Cao, Qiu-xiang Du, Qian-qian Jin, Ping Huang, Jun-hong Sun

Erschienen in: International Journal of Legal Medicine | Ausgabe 6/2020

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

Wound age estimation is a complex, multifactorial issue. It is considered to have great practical significance that combining multi-biomarkers and multi-methods for injury time estimation. We optimized our earlier “up, no change, or down” model by adding data on the expression levels of mRNAs encoding ABHD2, MAD2L2, and ARID5A, and we converted the relative quantitative expression levels of seven genes into a vector rather than a color model. We used Python to derive the cosine similarity (CS) between a test set and the vector matrix; the highest similarity most accurately reflected the injury time. For the optimized model, the internal and external verifications were approximately 0.71 and 0.66, respectively. The good double-blinded results indicated that the model was stable and reliable. In summary, we used a vector matrix and cosine similarities derived by Python to mine the levels of genes expressed in contused skeletal muscle. We are the first to combine several biomarkers and methods for wound age estimation.
Anhänge
Nur mit Berechtigung zugänglich
Literatur
Metadaten
Titel
Novel insights into wound age estimation: combined with “up, no change, or down” system and cosine similarity in python environment
verfasst von
Li-hong Dang
Na Feng
Guo-shuai An
Jie Cao
Qiu-xiang Du
Qian-qian Jin
Ping Huang
Jun-hong Sun
Publikationsdatum
09.09.2020
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
Erschienen in
International Journal of Legal Medicine / Ausgabe 6/2020
Print ISSN: 0937-9827
Elektronische ISSN: 1437-1596
DOI
https://doi.org/10.1007/s00414-020-02411-z

Weitere Artikel der Ausgabe 6/2020

International Journal of Legal Medicine 6/2020 Zur Ausgabe

Neu im Fachgebiet Rechtsmedizin

Molekularpathologische Untersuchungen im Wandel der Zeit

Open Access Biomarker Leitthema

Um auch an kleinen Gewebeproben zuverlässige und reproduzierbare Ergebnisse zu gewährleisten ist eine strenge Qualitätskontrolle in jedem Schritt des Arbeitsablaufs erforderlich. Eine nicht ordnungsgemäße Prüfung oder Behandlung des …

Vergleichende Pathologie in der onkologischen Forschung

Pathologie Leitthema

Die vergleichende experimentelle Pathologie („comparative experimental pathology“) ist ein Fachbereich an der Schnittstelle von Human- und Veterinärmedizin. Sie widmet sich der vergleichenden Erforschung von Gemeinsamkeiten und Unterschieden von …

Gastrointestinale Stromatumoren

Open Access GIST CME-Artikel

Gastrointestinale Stromatumoren (GIST) stellen seit über 20 Jahren ein Paradigma für die zielgerichtete Therapie mit Tyrosinkinaseinhibitoren dar. Eine elementare Voraussetzung für eine mögliche neoadjuvante oder adjuvante Behandlung bei …

Personalisierte Medizin in der Onkologie

Aufgrund des erheblichen technologischen Fortschritts in der molekularen und genetischen Diagnostik sowie zunehmender Erkenntnisse über die molekulare Pathogenese von Krankheiten hat in den letzten zwei Jahrzehnten ein grundlegender …