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Erschienen in: International Journal of Legal Medicine 2/2015

01.03.2015 | Population Data

Population genetics of 17 Y-chromosomal STRs loci in Garo and Santal tribal populations in Bangladesh

verfasst von: Mahamud Hasan, Pilu Momtaz, Ismail Hosen, Sudipta Arka Das, Sharif Akhteruzzaman

Erschienen in: International Journal of Legal Medicine | Ausgabe 2/2015

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Abstract

Allele frequencies and haplotype diversity of 17 Y-chromosomal short tandem repeat (STR) loci included in Y-filer™ PCR amplification kit were studied in 120 Garo and 139 Santal male individuals residing in two distinct regions of Bangladesh. A total of 99 different haplotypes from Garo and 129 different haplotypes from Santal individuals were observed with a corresponding discrimination capacity (DC) of 0.825 and 0.928, respectively. A comparison of the studied data with the published data from Y-STR haplotype reference database (YHRD) based on AMOVA revealed that the Garo population is closely related to Tripuri population from Tripura, India and Santal population moderately close to Munda population from Jharkhand, India. The mainstream Bengali population resides at a significant genetic distance from these two studied populations.
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Literatur
1.
2.
Zurück zum Zitat Walsh PS, Metzger DA, Higuchi R (1991) Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material. Biotechniques 10:506–513PubMed Walsh PS, Metzger DA, Higuchi R (1991) Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material. Biotechniques 10:506–513PubMed
3.
Zurück zum Zitat Gusmão L, Butler JM, Carracedo A, Gill AP, Kayser M, Mayr WR, Morling N, Prinz M, Roewer L, Tyler Smith C, Schneider PM (2006) DNA Commission of the International Society of Forensic Genetics (ISFG): an update of the recommendation on the use of Y-STRs in forensic analysis. Forensic Sci Int 157:187–197CrossRefPubMed Gusmão L, Butler JM, Carracedo A, Gill AP, Kayser M, Mayr WR, Morling N, Prinz M, Roewer L, Tyler Smith C, Schneider PM (2006) DNA Commission of the International Society of Forensic Genetics (ISFG): an update of the recommendation on the use of Y-STRs in forensic analysis. Forensic Sci Int 157:187–197CrossRefPubMed
4.
Zurück zum Zitat Williuweit S, Roewer L (2007) Y chromosome haplotype reference database (YHRD): update. Forensic Sci Int Genet 1:83–87CrossRef Williuweit S, Roewer L (2007) Y chromosome haplotype reference database (YHRD): update. Forensic Sci Int Genet 1:83–87CrossRef
5.
Zurück zum Zitat Schneider PM (2007) Scientific standards for studies in forensic genetics. Forensic Sci Int 165:238–243CrossRefPubMed Schneider PM (2007) Scientific standards for studies in forensic genetics. Forensic Sci Int 165:238–243CrossRefPubMed
6.
Zurück zum Zitat Caracedo A, Butler JM, Gusmão L, Parson W, Roewer L, Schneider PM (2010) Publication of population data for forensic purpose. Forensic Sci Int Genet 4:145–147CrossRef Caracedo A, Butler JM, Gusmão L, Parson W, Roewer L, Schneider PM (2010) Publication of population data for forensic purpose. Forensic Sci Int Genet 4:145–147CrossRef
7.
Zurück zum Zitat Alam S, Ali ME, Ferdous A, Hossain T, Hasan MM, Akhteruzzaman S (2010) Haplotype diversity of 17 Y-chromosomal STR loci in the Bangladeshi population. Forensic Sci Int Genet 4:e55–e60CrossRef Alam S, Ali ME, Ferdous A, Hossain T, Hasan MM, Akhteruzzaman S (2010) Haplotype diversity of 17 Y-chromosomal STR loci in the Bangladeshi population. Forensic Sci Int Genet 4:e55–e60CrossRef
8.
Zurück zum Zitat Roy S, Noor S, Haque I (2012) Genetic Analysis of 17 Ychromosomal STRs haplotype of three ethnic groups residing in West Bengal, India. Forensic Sci Int Genet 6:e5–e7CrossRefPubMed Roy S, Noor S, Haque I (2012) Genetic Analysis of 17 Ychromosomal STRs haplotype of three ethnic groups residing in West Bengal, India. Forensic Sci Int Genet 6:e5–e7CrossRefPubMed
Metadaten
Titel
Population genetics of 17 Y-chromosomal STRs loci in Garo and Santal tribal populations in Bangladesh
verfasst von
Mahamud Hasan
Pilu Momtaz
Ismail Hosen
Sudipta Arka Das
Sharif Akhteruzzaman
Publikationsdatum
01.03.2015
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
Erschienen in
International Journal of Legal Medicine / Ausgabe 2/2015
Print ISSN: 0937-9827
Elektronische ISSN: 1437-1596
DOI
https://doi.org/10.1007/s00414-014-0981-5

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