Skip to main content
Erschienen in: Archives of Virology 1/2015

01.01.2015 | Brief Report

Development of a multiplex real-time RT-PCR assay for simultaneous detection of dengue and chikungunya viruses

verfasst von: D. Cecilia, M. Kakade, K. Alagarasu, J. Patil, A. Salunke, D. Parashar, P. S. Shah

Erschienen in: Archives of Virology | Ausgabe 1/2015

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

Dengue and chikungunya viruses co-circulate and cause infections that start with similar symptoms but progress to radically different outcomes. Therefore, an early diagnostic test that can differentiate between the two is needed. A single-step multiplex real-time RT-PCR assay was developed that can simultaneously detect and quantitate RNA of all dengue virus (DENV) serotypes and chikungunya virus (CHIKV). The sensitivity was 100 % for DENV and 95.8 % for CHIKV, whilst the specificity was 100 % for both viruses when compared with conventional RT-PCR. The detection limit ranged from 1 to 50 plaque-forming units. The assay was successfully used for differential diagnosis of dengue and chikungunya in Pune, where the viruses co-circulate.
Literatur
2.
Zurück zum Zitat Myers RM, Carey DE (1967) Concurrent isolation from patient of two arboviruses, Chikungunya and dengue type 2. Science 157:1307–1308PubMedCrossRef Myers RM, Carey DE (1967) Concurrent isolation from patient of two arboviruses, Chikungunya and dengue type 2. Science 157:1307–1308PubMedCrossRef
3.
Zurück zum Zitat Leroy EM, Nkoghe D, Ollomo B, Nze-Nkogue C, Becquart P, Gerard G, Pourrut X, Charrel R, Moureau G, Ndjoyi-Mbiguino A, De-Lamballerie X (2009) Concurrent chikungunya and dengue virus infections during simultaneous outbreaks, Gabon, 2007. Emerg Infect Dis 15:591–593PubMedCentralPubMedCrossRef Leroy EM, Nkoghe D, Ollomo B, Nze-Nkogue C, Becquart P, Gerard G, Pourrut X, Charrel R, Moureau G, Ndjoyi-Mbiguino A, De-Lamballerie X (2009) Concurrent chikungunya and dengue virus infections during simultaneous outbreaks, Gabon, 2007. Emerg Infect Dis 15:591–593PubMedCentralPubMedCrossRef
4.
Zurück zum Zitat Chahar HS, Bharaj P, Dar L, Guleria R, Kabra SK, Broor S (2009) Co-infections with chikungunya virus and dengue virus in Delhi, India. Emerg Infect Dis 5:1077–1080CrossRef Chahar HS, Bharaj P, Dar L, Guleria R, Kabra SK, Broor S (2009) Co-infections with chikungunya virus and dengue virus in Delhi, India. Emerg Infect Dis 5:1077–1080CrossRef
5.
Zurück zum Zitat Kosasih H, de Mast Q, Widjaja S, Sudjana P, Antonjaya U, Ma’roef C, Riswari SF, Porter KR, Burgess TH, Alisjahbana B, van der Ven A, Williams M (2013) Evidence for endemic chikungunya virus infections in Bandung, Indonesia. PLoS Negl Trop Dis 7(10):e2483PubMedCentralPubMedCrossRef Kosasih H, de Mast Q, Widjaja S, Sudjana P, Antonjaya U, Ma’roef C, Riswari SF, Porter KR, Burgess TH, Alisjahbana B, van der Ven A, Williams M (2013) Evidence for endemic chikungunya virus infections in Bandung, Indonesia. PLoS Negl Trop Dis 7(10):e2483PubMedCentralPubMedCrossRef
6.
Zurück zum Zitat Dash PK, Parida MM, Santosh SR, Saxena P, Srivastava A, Neeraja M, Lakshmi V, Rao PV (2008) Development and evaluation of a 1-step duplex reverse transcription polymerase chain reaction for differential diagnosis of chikungunya and dengue infection. Diagn Microbiol Infect Dis 62:52–57PubMedCrossRef Dash PK, Parida MM, Santosh SR, Saxena P, Srivastava A, Neeraja M, Lakshmi V, Rao PV (2008) Development and evaluation of a 1-step duplex reverse transcription polymerase chain reaction for differential diagnosis of chikungunya and dengue infection. Diagn Microbiol Infect Dis 62:52–57PubMedCrossRef
7.
Zurück zum Zitat Pongsiri P, Praianantathavorn K, Theamboonlers A, Payungporn S, Poovorawan Y (2012) Multiplex real-time RT-PCR for detecting chikungunya virus and dengue virus. Asian Pac J Trop Med 5(5):342–346PubMedCrossRef Pongsiri P, Praianantathavorn K, Theamboonlers A, Payungporn S, Poovorawan Y (2012) Multiplex real-time RT-PCR for detecting chikungunya virus and dengue virus. Asian Pac J Trop Med 5(5):342–346PubMedCrossRef
8.
Zurück zum Zitat Gurukumar KR, Priyadarshini D, Patil JA, Bhagat A, Singh A, Shah PS, Cecilia D (2009) Development of real time PCR for detection and quantitation of dengue viruses. Virol J 6:10PubMedCentralPubMedCrossRef Gurukumar KR, Priyadarshini D, Patil JA, Bhagat A, Singh A, Shah PS, Cecilia D (2009) Development of real time PCR for detection and quantitation of dengue viruses. Virol J 6:10PubMedCentralPubMedCrossRef
9.
Zurück zum Zitat Lanciotti RS, Calisher CH, Gubler DJ, Chang GJ, Vorndam AV (1992) Rapid detection and typing of dengue viruses from clinical samples by using reverse transcriptase-polymerase chain reaction. J Clin Microbiol 30:545–551PubMedCentralPubMed Lanciotti RS, Calisher CH, Gubler DJ, Chang GJ, Vorndam AV (1992) Rapid detection and typing of dengue viruses from clinical samples by using reverse transcriptase-polymerase chain reaction. J Clin Microbiol 30:545–551PubMedCentralPubMed
10.
Zurück zum Zitat Hasebe F, Parquet MC, Pandey BD, Mathenge EG, Morita K, Balasubramaniam V, Saat Z, Yusop A, Sinniah M, Natkunam S, Igarashi A (2002) Combined detection and genotyping of Chikungunya virus by a specific reverse transcription-polymerase chain reaction. J Med Virol 67:370–374PubMedCrossRef Hasebe F, Parquet MC, Pandey BD, Mathenge EG, Morita K, Balasubramaniam V, Saat Z, Yusop A, Sinniah M, Natkunam S, Igarashi A (2002) Combined detection and genotyping of Chikungunya virus by a specific reverse transcription-polymerase chain reaction. J Med Virol 67:370–374PubMedCrossRef
11.
Zurück zum Zitat Houng HS, Chung-Ming Chen R, Vaughn DW, Kanesathasan N (2001) Development of a fluorogenic RT-PCR system for quantitative identification of dengue virus serotypes 1–4 using conserved and serotype-specific 3′ noncoding sequences. J Virol Methods 95:19–32. doi:10.1016/S0166-0934(01)00280-4 PubMedCrossRef Houng HS, Chung-Ming Chen R, Vaughn DW, Kanesathasan N (2001) Development of a fluorogenic RT-PCR system for quantitative identification of dengue virus serotypes 1–4 using conserved and serotype-specific 3′ noncoding sequences. J Virol Methods 95:19–32. doi:10.​1016/​S0166-0934(01)00280-4 PubMedCrossRef
12.
Zurück zum Zitat Parashar D, Paingankar MS, Kumar S, Gokhale MD, Sudeep AB, Shinde SB, Arankalle VA (2013) Administration of E2 and NS1 siRNAs inhibit chikungunya virus replication in vitro and protects mice infected with the virus. PLoS Negl Trop Dis 7(9):e2405PubMedCentralPubMedCrossRef Parashar D, Paingankar MS, Kumar S, Gokhale MD, Sudeep AB, Shinde SB, Arankalle VA (2013) Administration of E2 and NS1 siRNAs inhibit chikungunya virus replication in vitro and protects mice infected with the virus. PLoS Negl Trop Dis 7(9):e2405PubMedCentralPubMedCrossRef
13.
Zurück zum Zitat Mocellin S, Panelli M, Wang E, Rossi CR, Pilati P, Nitti D, Lise M, Marincola FM (2004) IL-10 stimulatory effects on human NK cells explored by gene profile analysis. Genes Immun 5:621–630PubMedCrossRef Mocellin S, Panelli M, Wang E, Rossi CR, Pilati P, Nitti D, Lise M, Marincola FM (2004) IL-10 stimulatory effects on human NK cells explored by gene profile analysis. Genes Immun 5:621–630PubMedCrossRef
14.
Zurück zum Zitat Velathanthiri VG, Fernando S, Malavige GN, Peelawatta M, Jayaratne SD, Aaskov J (2006) Comparison of serology, virus isolation and RT-PCR in the diagnosis of dengue viral infections in Sri Lanka. Dengue Bull 30:191 Velathanthiri VG, Fernando S, Malavige GN, Peelawatta M, Jayaratne SD, Aaskov J (2006) Comparison of serology, virus isolation and RT-PCR in the diagnosis of dengue viral infections in Sri Lanka. Dengue Bull 30:191
15.
Zurück zum Zitat Klungthong C, Gibbons RV, Thaisomboonsuk B, Nisalak A, Kalayanarooj S, Thirawuth V, Nutkumhang N, Mammen MP Jr, Jarman RG (2007) Dengue virus detection using whole blood for reverse transcriptase PCR and virus isolation. J Clin Microbiol 45:2480–2485PubMedCentralPubMedCrossRef Klungthong C, Gibbons RV, Thaisomboonsuk B, Nisalak A, Kalayanarooj S, Thirawuth V, Nutkumhang N, Mammen MP Jr, Jarman RG (2007) Dengue virus detection using whole blood for reverse transcriptase PCR and virus isolation. J Clin Microbiol 45:2480–2485PubMedCentralPubMedCrossRef
Metadaten
Titel
Development of a multiplex real-time RT-PCR assay for simultaneous detection of dengue and chikungunya viruses
verfasst von
D. Cecilia
M. Kakade
K. Alagarasu
J. Patil
A. Salunke
D. Parashar
P. S. Shah
Publikationsdatum
01.01.2015
Verlag
Springer Vienna
Erschienen in
Archives of Virology / Ausgabe 1/2015
Print ISSN: 0304-8608
Elektronische ISSN: 1432-8798
DOI
https://doi.org/10.1007/s00705-014-2217-x

Weitere Artikel der Ausgabe 1/2015

Archives of Virology 1/2015 Zur Ausgabe

Leitlinien kompakt für die Innere Medizin

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag

Reizdarmsyndrom: Diäten wirksamer als Medikamente

29.04.2024 Reizdarmsyndrom Nachrichten

Bei Reizdarmsyndrom scheinen Diäten, wie etwa die FODMAP-arme oder die kohlenhydratreduzierte Ernährung, effektiver als eine medikamentöse Therapie zu sein. Das hat eine Studie aus Schweden ergeben, die die drei Therapieoptionen im direkten Vergleich analysierte.

Notfall-TEP der Hüfte ist auch bei 90-Jährigen machbar

26.04.2024 Hüft-TEP Nachrichten

Ob bei einer Notfalloperation nach Schenkelhalsfraktur eine Hemiarthroplastik oder eine totale Endoprothese (TEP) eingebaut wird, sollte nicht allein vom Alter der Patientinnen und Patienten abhängen. Auch über 90-Jährige können von der TEP profitieren.

Niedriger diastolischer Blutdruck erhöht Risiko für schwere kardiovaskuläre Komplikationen

25.04.2024 Hypotonie Nachrichten

Wenn unter einer medikamentösen Hochdrucktherapie der diastolische Blutdruck in den Keller geht, steigt das Risiko für schwere kardiovaskuläre Ereignisse: Darauf deutet eine Sekundäranalyse der SPRINT-Studie hin.

Bei schweren Reaktionen auf Insektenstiche empfiehlt sich eine spezifische Immuntherapie

Insektenstiche sind bei Erwachsenen die häufigsten Auslöser einer Anaphylaxie. Einen wirksamen Schutz vor schweren anaphylaktischen Reaktionen bietet die allergenspezifische Immuntherapie. Jedoch kommt sie noch viel zu selten zum Einsatz.

Update Innere Medizin

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.