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01.12.2014 | Research Article | Ausgabe 6/2014

Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine 6/2014

Spatio-temporal wavelet regularization for parallel MRI reconstruction: application to functional MRI

Zeitschrift:
Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine > Ausgabe 6/2014
Autoren:
Lotfi Chaari, Philippe Ciuciu, Sébastien Mériaux, Jean-Christophe Pesquet
Wichtige Hinweise
Part of this work has been presented at the IEEE ISBI 2011 conference [1].

Abstract

Background

Parallel magnetic resonance imaging (MRI) is a fast imaging technique that helps acquiring highly resolved images in space/time. Its performance depends on the reconstruction algorithm, which can proceed either in the k-space or in the image domain.

Objective and methods

To improve the performance of the widely used SENSE algorithm, 2D regularization in the wavelet domain has been investigated. In this paper, we first extend this approach to 3D-wavelet representations and the 3D sparsity-promoting regularization term, in order to address reconstruction artifacts that propagate across adjacent slices. The resulting optimality criterion is convex but nonsmooth, and we resort to the parallel proximal algorithm to minimize it. Second, to account for temporal correlation between successive scans in functional MRI (fMRI), we extend our first contribution to 3D + \(t\) acquisition schemes by incorporating a prior along the time axis into the objective function.

Results

Our first method (3D-UWR-SENSE) is validated on T1-MRI anatomical data for gray/white matter segmentation. The second method (4D-UWR-SENSE) is validated for detecting evoked activity during a fast event-related functional MRI protocol.

Conclusion

We show that our algorithm outperforms the SENSE reconstruction at the subject and group levels (15 subjects) for different contrasts of interest (motor or computation tasks) and two parallel acceleration factors (\(R=2\) and \(R=4\)) on \(2\times 2\times 3\,\hbox{mm}^3\) echo planar imaging (EPI) images.

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