Skip to main content
Erschienen in: Pediatric Nephrology 7/2022

15.10.2021 | Review

The pediatric urobiome in genitourinary conditions: a narrative review

verfasst von: Elisabeth Cole, Nader Shaikh, Catherine S. Forster

Erschienen in: Pediatric Nephrology | Ausgabe 7/2022

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

The microbial ecosystem within the bladder that can be measured within the urine, or urobiome, is an emerging field of study with little published data regarding children. However, investigations into urobiome research have the potential to significantly impact the understanding of the pathophysiology of genitourinary conditions, as well as potentially identify novel therapeutics. Therefore, both researchers and clinicians should be aware of pediatric urobiome research. The purpose of this review is to highlight the literature around urobiome research in urinary tract infections, nephrolithiasis, and neurogenic bladder; comment on pediatric-specific considerations when reading and interpreting the urobiome literature; and to identify new potential areas of research.
Literatur
2.
Zurück zum Zitat Janda JM, Abbott SL (2007) 16S rRNA gene sequencing for bacterial identification in the diagnostic laboratory: pluses, perils, and pitfalls. J Clin Microbiol 45:2761–2764CrossRef Janda JM, Abbott SL (2007) 16S rRNA gene sequencing for bacterial identification in the diagnostic laboratory: pluses, perils, and pitfalls. J Clin Microbiol 45:2761–2764CrossRef
7.
Zurück zum Zitat Emerson JB, Adams RI, Román CMB, Brooks B, Coil DA, Dahlhausen K, Ganz HH, Hartmann EM, Hsu T, Justice NB, Paulino-Lima IG, Luongo JC, Lymperopoulou DS, Gomez-Silvan C, Rothschild-Mancinelli B, Balk M, Huttenhower C, Nocker A, Vaishampayan P, Rothschild LJ (2017) Schrödinger’s microbes: tools for distinguishing the living from the dead in microbial ecosystems. Microbiome 5:86CrossRef Emerson JB, Adams RI, Román CMB, Brooks B, Coil DA, Dahlhausen K, Ganz HH, Hartmann EM, Hsu T, Justice NB, Paulino-Lima IG, Luongo JC, Lymperopoulou DS, Gomez-Silvan C, Rothschild-Mancinelli B, Balk M, Huttenhower C, Nocker A, Vaishampayan P, Rothschild LJ (2017) Schrödinger’s microbes: tools for distinguishing the living from the dead in microbial ecosystems. Microbiome 5:86CrossRef
25.
Zurück zum Zitat Tavichakorntrakool R, Prasongwattana V, Sungkeeree S, Saisud P, Sribenjalux P, Pimratana C, Bovornpadungkitti S, Sriboonlue P, Thongboonkerd V (2012) Extensive characterizations of bacteria isolated from catheterized urine and stone matrices in patients with nephrolithiasis. Nephrol Dial Transplant 27:4125–4130. https://doi.org/10.1093/ndt/gfs057CrossRefPubMed Tavichakorntrakool R, Prasongwattana V, Sungkeeree S, Saisud P, Sribenjalux P, Pimratana C, Bovornpadungkitti S, Sriboonlue P, Thongboonkerd V (2012) Extensive characterizations of bacteria isolated from catheterized urine and stone matrices in patients with nephrolithiasis. Nephrol Dial Transplant 27:4125–4130. https://​doi.​org/​10.​1093/​ndt/​gfs057CrossRefPubMed
37.
Zurück zum Zitat Fouts DE, Pieper R, Szpakowski S, Pohl H, Knoblach S, Suh M-J, Huang S-T, Ljungberg I, Sprague BM, Lucas SK, Torralba M, Nelson KE, Groah SL (2012) Integrated next-generation sequencing of 16S rDNA and metaproteomics differentiate the healthy urine microbiome from asymptomatic bacteriuria in neuropathic bladder associated with spinal cord injury. J Transl Med 10:174. https://doi.org/10.1186/1479-5876-10-174CrossRefPubMedPubMedCentral Fouts DE, Pieper R, Szpakowski S, Pohl H, Knoblach S, Suh M-J, Huang S-T, Ljungberg I, Sprague BM, Lucas SK, Torralba M, Nelson KE, Groah SL (2012) Integrated next-generation sequencing of 16S rDNA and metaproteomics differentiate the healthy urine microbiome from asymptomatic bacteriuria in neuropathic bladder associated with spinal cord injury. J Transl Med 10:174. https://​doi.​org/​10.​1186/​1479-5876-10-174CrossRefPubMedPubMedCentral
45.
Zurück zum Zitat Thomas-White K, Taege S, Limeira R, Brincat C, Joyce C, Hilt EE, Mac-Daniel L, Radek KA, Brubaker L, Mueller ER, Wolfe AJ (2020) Vaginal estrogen therapy is associated with increased Lactobacillus in the urine of postmenopausal women with overactive bladder symptoms. Am J Obstet Gynecol 223:727.e1-727.e11. https://doi.org/10.1016/j.ajog.2020.08.006CrossRef Thomas-White K, Taege S, Limeira R, Brincat C, Joyce C, Hilt EE, Mac-Daniel L, Radek KA, Brubaker L, Mueller ER, Wolfe AJ (2020) Vaginal estrogen therapy is associated with increased Lactobacillus in the urine of postmenopausal women with overactive bladder symptoms. Am J Obstet Gynecol 223:727.e1-727.e11. https://​doi.​org/​10.​1016/​j.​ajog.​2020.​08.​006CrossRef
46.
47.
Zurück zum Zitat Komesu YM, Dinwiddie DL, Richter HE, Lukacz ES, Sung VW, Siddiqui NY, Zyczynski HM, Ridgeway B, Rogers RG, Arya LA, Mazloomdoost D, Levy J, Carper B, Gantz MG, Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development Pelvic Floor Disorders Network (2020) Defining the relationship between vaginal and urinary microbiomes. Am J Obstet Gynecol 222:154.e1-154.e10. https://doi.org/10.1016/j.ajog.2019.08.011CrossRef Komesu YM, Dinwiddie DL, Richter HE, Lukacz ES, Sung VW, Siddiqui NY, Zyczynski HM, Ridgeway B, Rogers RG, Arya LA, Mazloomdoost D, Levy J, Carper B, Gantz MG, Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development Pelvic Floor Disorders Network (2020) Defining the relationship between vaginal and urinary microbiomes. Am J Obstet Gynecol 222:154.e1-154.e10. https://​doi.​org/​10.​1016/​j.​ajog.​2019.​08.​011CrossRef
50.
Zurück zum Zitat Pearce MM, Zilliox MJ, Rosenfeld AB, Thomas-White KJ, Richter HE, Nager CW, Visco AG, Nygaard IE, Barber MD, Schaffer J, Moalli P, Sung VW, Smith AL, Rogers R, Nolen TL, Wallace D, Meikle SF, Gai X, Wolfe AJ, Brubaker L; Pelvic Floor Disorders Network (2015) The female urinary microbiome in urgency urinary incontinence. Am J Obstet Gynecol 213:347.e1–11. https://doi.org/10.1016/j.ajog.2015.07.009CrossRef Pearce MM, Zilliox MJ, Rosenfeld AB, Thomas-White KJ, Richter HE, Nager CW, Visco AG, Nygaard IE, Barber MD, Schaffer J, Moalli P, Sung VW, Smith AL, Rogers R, Nolen TL, Wallace D, Meikle SF, Gai X, Wolfe AJ, Brubaker L; Pelvic Floor Disorders Network (2015) The female urinary microbiome in urgency urinary incontinence. Am J Obstet Gynecol 213:347.e1–11. https://​doi.​org/​10.​1016/​j.​ajog.​2015.​07.​009CrossRef
55.
Zurück zum Zitat Jansson UB, Hanson M, Hanson E, Hellström AL, Sillén U (2000) Voiding pattern in healthy children 0 to 3 years old: a longitudinal study. J Urol 164:2050–2054CrossRef Jansson UB, Hanson M, Hanson E, Hellström AL, Sillén U (2000) Voiding pattern in healthy children 0 to 3 years old: a longitudinal study. J Urol 164:2050–2054CrossRef
Metadaten
Titel
The pediatric urobiome in genitourinary conditions: a narrative review
verfasst von
Elisabeth Cole
Nader Shaikh
Catherine S. Forster
Publikationsdatum
15.10.2021
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
Erschienen in
Pediatric Nephrology / Ausgabe 7/2022
Print ISSN: 0931-041X
Elektronische ISSN: 1432-198X
DOI
https://doi.org/10.1007/s00467-021-05274-7

Weitere Artikel der Ausgabe 7/2022

Pediatric Nephrology 7/2022 Zur Ausgabe

ADHS-Medikation erhöht das kardiovaskuläre Risiko

16.05.2024 Herzinsuffizienz Nachrichten

Erwachsene, die Medikamente gegen das Aufmerksamkeitsdefizit-Hyperaktivitätssyndrom einnehmen, laufen offenbar erhöhte Gefahr, an Herzschwäche zu erkranken oder einen Schlaganfall zu erleiden. Es scheint eine Dosis-Wirkungs-Beziehung zu bestehen.

Erstmanifestation eines Diabetes-Typ-1 bei Kindern: Ein Notfall!

16.05.2024 DDG-Jahrestagung 2024 Kongressbericht

Manifestiert sich ein Typ-1-Diabetes bei Kindern, ist das ein Notfall – ebenso wie eine diabetische Ketoazidose. Die Grundsäulen der Therapie bestehen aus Rehydratation, Insulin und Kaliumgabe. Insulin ist das Medikament der Wahl zur Behandlung der Ketoazidose.

Frühe Hypertonie erhöht späteres kardiovaskuläres Risiko

Wie wichtig es ist, pädiatrische Patienten auf Bluthochdruck zu screenen, zeigt eine kanadische Studie: Hypertone Druckwerte in Kindheit und Jugend steigern das Risiko für spätere kardiovaskuläre Komplikationen.

Betalaktam-Allergie: praxisnahes Vorgehen beim Delabeling

16.05.2024 Pädiatrische Allergologie Nachrichten

Die große Mehrheit der vermeintlichen Penicillinallergien sind keine. Da das „Etikett“ Betalaktam-Allergie oft schon in der Kindheit erworben wird, kann ein frühzeitiges Delabeling lebenslange Vorteile bringen. Ein Team von Pädiaterinnen und Pädiatern aus Kanada stellt vor, wie sie dabei vorgehen.

Update Pädiatrie

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.