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Neurosurgical Review

Erschienen in:

01.02.2021 | Original Article

Identification of N⁶-methyladenosine-related lncRNAs for patients with primary glioblastoma

verfasst von: Wen Wang, Junsheng Li, Fa Lin, Jia Guo, Jizong Zhao

Erschienen in: Neurosurgical Review | Ausgabe 1/2021

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Abstract

To investigate the m⁶a-related long non-coding RNAs (lncRNAs) that may be exploited as potential biomarkers in primary glioblastoma (pGBM), a cohort of 268 glioma samples from GSE16011 dataset was included for discovery. The Chinese Glioma Genome Atlas (CGGA) microarray and RNA sequencing databases were used for validation. Bioinformatic analyses were performed using the R software. The m⁶a-lncRNA co-expression networks were constructed, and four m⁶a-related lncRNAs (MIR9-3HG, LINC00900, MIR155HG, and LINC00515) were identified in pGBM patients on the univariate Cox regression analysis. Patients in the low-risk group had longer overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) than those in the high-risk group (P = 0.0025, P = 0.0070). Moreover, the high-risk group displayed older age, isocitrate dehydrogenase (IDH) wild-type, classical and mesenchymal TCGA subtype, and G3 CGGA subtype. Distinct m⁶a status was identified according to histologic grade and two groups (low-risk and high-risk). Functional annotation showed that differentially expressed genes between the two groups were enriched in immune response, apoptosis, cell adhesion, negative regulation of transcription, negative regulation of RNA metabolic process, and regulation of RNA metabolic process. We profiled the m⁶a status in glioma and identified four m⁶a-related prognostic lncRNAs for pGBMs.

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Titel: Identification of N6-methyladenosine-related lncRNAs for patients with primary glioblastoma
verfasst von: Wen Wang
Junsheng Li
Fa Lin
Jia Guo
Jizong Zhao
Publikationsdatum: 01.02.2021
Verlag: Springer Berlin Heidelberg
Erschienen in: Neurosurgical Review / Ausgabe 1/2021
Print ISSN: 0344-5607
Elektronische ISSN: 1437-2320
DOI: https://doi.org/10.1007/s10143-020-01238-x

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