nach oben

International Journal of Colorectal Disease

Erschienen in:

01.11.2010 | Original Article

Integration of genetic signature and TNM staging system for predicting the relapse of locally advanced colorectal cancer

verfasst von: Junjie Peng, Zhimin Wang, Wei Chen, Yin Ding, Haifeng Wang, Hongjie Huang, Wei Huang, Sanjun Cai

Erschienen in: International Journal of Colorectal Disease | Ausgabe 11/2010

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

Purpose

To identify potential genetic markers in treated stage II–III colorectal cancer patients and predict 3-year tumor relapse using statistical models based on important clinical factors and significant genetic markers.

Methods

Gene expression profiling by cDNA-mediated Annealing, Selection, extension and Ligation assay was performed in a prospectively collected 95 stage II–III colorectal cancer patients with Fluorouracil-based adjuvant chemotherapy. We studied the gene expression level of 502 genes for patients with different outcomes. The prognostic effect of genetic signature was evaluated in multivariate analysis. We further integrated the genetic signature to clinical Classification of Malignant Tumors (TNM) staging system for predicting of 3-year tumor relapse.

Results

An 8-gene signature was identified to well discriminate patients with different treatment outcomes. An integrated risk factor, which including 8-gene signature and TNM staging has been developed. ROC curve revealed that our integrated risk factor was better than genetic signature or current sixth edition TNM staging system alone.

Conclusions

Our 8-gene signature was promising in predicting 3-year disease-free survival rate for locally advanced colorectal cancer. The integrated risk factor, which combining genetic signature with clinical TNM staging system may further improve the outcome prediction.

Jemal A, Siegel R, Ward E, Murray T, Xu J, Thun M (2007) Cancer statistics, 2007. CA Cancer J Clin 57:43–66CrossRefPubMed

Greene FL, Page D, Fleming ID et al (eds) (2002) AJCC cancer staging manual, 6th edn. Springer, New York

Compton C, Greene F (2004) The staging of colorectal cancer: 2004 and beyond. CA Cancer J Clin 54:295–308CrossRefPubMed

O’Connell J, Maggard M, Ko C (2004) Colon cancer survival rates with the new American Joint Committee on Cancer sixth edition staging. J Natl Cancer Inst 96:1420–1425CrossRefPubMed

Bibikova M, Talantov D, Chudin E, Yeakley J, Chen J, Doucet D et al (2004) Quantitative gene expression profiling in formalin-fixed, paraffin-embedded tissues using universal bead arrays. Am J Pathol 165:1799–1807PubMed

Haller A, Kanakapalli D, Walter R, Alhasan S, Eliason J, Everson R (2006) Transcriptional profiling of degraded RNA in cryopreserved and fixed tissue samples obtained at autopsy. BMC Clin Pathol 6:9CrossRefPubMed

Illumina: Gene Expression on Sentrix Arrays: DASL Assay System Manual. Doc # 11175105 edn: Illumina Inc 2004

Fan J, Yeakley J, Bibikova M, Chudin E, Wickham E, Chen J et al (2004) A versatile assay for high-throughput gene expression profiling on universal array matrices. Genome Res 14:878–885CrossRefPubMed

Illumina. BeadStudio User Guide. vol Doc # 11179632 Rev A San Diego: Illumina Inc 2004

10.

Bolstad B, Irizarry R, Astrand M, Speed T (2003) A comparison of normalization methods for high density oligonucleotide array data based on variance and bias. Bioinformatics 19:185–193CrossRefPubMed

11.

Dunning M, Smith M, Ritchie M, Tavare S (2007) beadarray: R classes and methods for Illumina bead-based data. Bioinformatics 23:2183–2184CrossRefPubMed

12.

Chen H, Yu S, Chen C, Chang G, Chen C, Yuan A et al (2007) A five-gene signature and clinical outcome in non-small-cell lung cancer. N Engl J Med 356:11–20CrossRefPubMed

13.

Jeong SY, Chessin DB, Schrag D, Riedel E, Wong WD, Guillem JG (2005) Re: Colon cancer survival rates with the new American Joint Committee on Cancer sixth edition staging. J Natl Cancer Inst 97:1705–1706, author reply 6–7CrossRefPubMed

14.

Alvarado M, Jensen E, Yeatman T (2006) The potential role of gene expression in the management of primary and metastatic colorectal cancer. Cancer Control 13:27–31PubMed

15.

Barrier A, Boelle P, Roser F, Gregg J, Tse C, Brault D et al (2006) Stage II colon cancer prognosis prediction by tumor gene expression profiling. J Clin Oncol 24:4685–4691CrossRefPubMed

16.

Bustin S, Dorudi S (2004) Gene expression profiling for molecular staging and prognosis prediction in colorectal cancer. Expert Rev Mol Diagn 4:599–607CrossRefPubMed

17.

Cardoso J, Boer J, Morreau H, Fodde R (2007) Expression and genomic profiling of colorectal cancer. Biochim Biophys Acta 1775:103–137PubMed

18.

Wang Y, Jatkoe T, Zhang Y, Mutch M, Talantov D, Jiang J et al (2004) Gene expression profiles and molecular markers to predict recurrence of Dukes’ B colon cancer. J Clin Oncol 22:1564–1571CrossRefPubMed

19.

Garman KS, Acharya CR, Edelman E, Grade M, Gaedcke J, Sud S et al (2008) A genomic approach to colon cancer risk stratification yields biologic insights into therapeutic opportunities. Proc Natl Acad Sci USA 105:19432–19437CrossRefPubMed

20.

Watanabe T, Kobunai T, Toda E, Kanazawa T, Kazama Y, Tanaka J et al (2007) Gene expression signature and the prediction of ulcerative colitis-associated colorectal cancer by DNA microarray. Clin Cancer Res 13:415–420CrossRefPubMed

21.

Arango D, Laiho P, Kokko A, Alhopuro P, Sammalkorpi H, Salovaara R et al (2005) Gene-expression profiling predicts recurrence in Dukes’ C colorectal cancer. Gastroenterology 129:874–884CrossRefPubMed

22.

Eschrich S (2005) Molecular staging for survival prediction of colorectal cancer patients. J Clin Oncol 23:3526–3535CrossRefPubMed

23.

Wiese AH, Auer J, Lassmann S, Nahrig J, Rosenberg R, Hofler H et al (2007) Identification of gene signatures for invasive colorectal tumor cells. Cancer Detect Prev 31:282–295CrossRefPubMed

24.

Gentner B, Wein A, Croner RS, Zeittraeger I, Wirtz RM, Roedel F et al (2009) Differences in the gene expression profile of matrix metalloproteinases (MMPs) and their inhibitors (TIMPs) in primary colorectal tumors and their synchronous liver metastases. Anticancer Res 29:67–74PubMed

25.

Theret N, Musso O, Campion JP, Turlin B, Loreal O, L’Helgoualc’h A et al (1997) Overexpression of matrix metalloproteinase-2 and tissue inhibitor of matrix metalloproteinase-2 in liver from patients with gastrointestinal adenocarcinoma and no detectable metastasis. Int J Cancer 74:426–432CrossRefPubMed

26.

Morimoto LM, Newcomb PA, White E, Bigler J, Potter JD (2005) Insulin-like growth factor polymorphisms and colorectal cancer risk. Canc Epidemiol Biomarkers Prev 14:1204–1211CrossRef

27.

Alberti KG, Zimmet P, Shaw J (2005) The metabolic syndrome—a new worldwide definition. Lancet 366:1059–1062CrossRefPubMed

28.

Sirvent A, Benistant C, Pannequin J, Veracini L, Simon V, Bourgaux JF et al (2010) Src family tyrosine kinases-driven colon cancer cell invasion is induced by Csk membrane delocalization. Oncogene 29:1303–1315CrossRefPubMed

29.

Ingley E (2008) Src family kinases: regulation of their activities, levels and identification of new pathways. Biochim Biophys Acta 1784:56–65PubMed

30.

Luangdilok S, Box C, Patterson L, Court W, Harrington K, Pitkin L et al (2007) Syk tyrosine kinase is linked to cell motility and progression in squamous cell carcinomas of the head and neck. Cancer Res 67:7907–7916CrossRefPubMed

31.

Moroni M, Soldatenkov V, Zhang L, Zhang Y, Stoica G, Gehan E et al (2004) Progressive loss of Syk and abnormal proliferation in breast cancer cells. Cancer Res 64:7346–7354CrossRefPubMed

32.

Kang HJ, Kim HJ, Kim SK, Barouki R, Cho CH, Khanna KK et al (2006) BRCA1 modulates xenobiotic stress-inducible gene expression by interacting with ARNT in human breast cancer cells. J Biol Chem 281:14654–14662CrossRefPubMed

33.

Beischlag TV, Perdew GH (2005) ER alpha-AHR-ARNT protein-protein interactions mediate estradiol-dependent transrepression of dioxin-inducible gene transcription. J Biol Chem 280:21607–21611CrossRefPubMed

34.

Lofstedt T, Fredlund E, Noguera R, Navarro S, Holmquist-Mengelbier L, Beckman S et al (2009) HIF-1alpha induces MXI1 by alternate promoter usage in human neuroblastoma cells. Exp Cell Res 315:1924–1936CrossRefPubMed

35.

Taj MM, Tawil RJ, Engstrom LD, Zeng Z, Hwang C, Sanda MG et al (2001) Mxi1, a Myc antagonist, suppresses proliferation of DU145 human prostate cells. Prostate 47:194–204CrossRefPubMed

36.

Camilleri-Broet S, Cremer I, Marmey B, Comperat E, Viguie F, Audouin J et al (2007) TRAF4 overexpression is a common characteristic of human carcinomas. Oncogene 26:142–147CrossRefPubMed

37.

Tomasetto C, Regnier CH, Rio MC (1998) TRAF-4 expression in breast carcinomas. Am J Pathol 153:2007–2008PubMed

38.

Dejmek J, Leandersson K, Manjer J, Bjartell A, Emdin SO, Vogel WF et al (2005) Expression and signaling activity of Wnt-5a/discoidin domain receptor-1 and Syk plays distinct but decisive roles in breast cancer patient survival. Clin Cancer Res 11:520–528PubMed

Titel: Integration of genetic signature and TNM staging system for predicting the relapse of locally advanced colorectal cancer
verfasst von: Junjie Peng
Zhimin Wang
Wei Chen
Yin Ding
Haifeng Wang
Hongjie Huang
Wei Huang
Sanjun Cai
Publikationsdatum: 01.11.2010
Verlag: Springer-Verlag
Erschienen in: International Journal of Colorectal Disease / Ausgabe 11/2010
Print ISSN: 0179-1958
Elektronische ISSN: 1432-1262
DOI: https://doi.org/10.1007/s00384-010-1043-1

Neu im Fachgebiet Chirurgie

Echinokokkose medikamentös behandeln oder operieren?

06.05.2024 DCK 2024 Kongressbericht

Die Therapie von Echinokokkosen sollte immer in spezialisierten Zentren erfolgen. Eine symptomlose Echinokokkose kann – egal ob von Hunde- oder Fuchsbandwurm ausgelöst – konservativ erfolgen. Wenn eine Op. nötig ist, kann es sinnvoll sein, vorher Zysten zu leeren und zu desinfizieren.

Wie sieht der OP der Zukunft aus?

04.05.2024 DCK 2024 Kongressbericht

Der OP in der Zukunft wird mit weniger Personal auskommen – nicht, weil die Technik das medizinische Fachpersonal verdrängt, sondern weil der Personalmangel es nötig macht.

Umsetzung der POMGAT-Leitlinie läuft

03.05.2024 DCK 2024 Kongressbericht

Seit November 2023 gibt es evidenzbasierte Empfehlungen zum perioperativen Management bei gastrointestinalen Tumoren (POMGAT) auf S3-Niveau. Vieles wird schon entsprechend der Empfehlungen durchgeführt. Wo es im Alltag noch hapert, zeigt eine Umfrage in einem Klinikverbund.

Recycling im OP – möglich, aber teuer

02.05.2024 DCK 2024 Kongressbericht

Auch wenn sich Krankenhäuser nachhaltig und grün geben – sie tragen aktuell erheblich zu den CO₂-Emissionen bei und produzieren jede Menge Müll. Ein Pilotprojekt aus Bonn zeigt, dass viele Op.-Abfälle wiederverwertet werden können.

Update Chirurgie

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.

Newsletter bestellen

Aktuelle BDC Leitlinien-Webinare

S3-Leitlinie „Diagnostik und Therapie des Karpaltunnelsyndroms“

Karpaltunnelsyndrom BDC Leitlinien Webinare

CME: 2 Punkte

Das Karpaltunnelsyndrom ist die häufigste Kompressionsneuropathie peripherer Nerven. Obwohl die Anamnese mit dem nächtlichen Einschlafen der Hand (Brachialgia parästhetica nocturna) sehr typisch ist, ist eine klinisch-neurologische Untersuchung und Elektroneurografie in manchen Fällen auch eine Neurosonografie erforderlich. Im Anfangsstadium sind konservative Maßnahmen (Handgelenksschiene, Ergotherapie) empfehlenswert. Bei nicht Ansprechen der konservativen Therapie oder Auftreten von neurologischen Ausfällen ist eine Dekompression des N. medianus am Karpaltunnel indiziert.

Prof. Dr. med. Gregor Antoniadis

S2e-Leitlinie „Distale Radiusfraktur“

Radiusfraktur BDC Leitlinien Webinare

CME: 2 Punkte

Das Webinar beschäftigt sich mit Fragen und Antworten zu Diagnostik und Klassifikation sowie Möglichkeiten des Ausschlusses von Zusatzverletzungen. Die Referenten erläutern, welche Frakturen konservativ behandelt werden können und wie. Das Webinar beantwortet die Frage nach aktuellen operativen Therapiekonzepten: Welcher Zugang, welches Osteosynthesematerial? Auf was muss bei der Nachbehandlung der distalen Radiusfraktur geachtet werden?

PD Dr. med. Oliver Pieske

Dr. med. Benjamin Meyknecht

S1-Leitlinie „Empfehlungen zur Therapie der akuten Appendizitis bei Erwachsenen“

Appendizitis BDC Leitlinien Webinare

CME: 2 Punkte

Inhalte des Webinars zur S1-Leitlinie „Empfehlungen zur Therapie der akuten Appendizitis bei Erwachsenen“ sind die Darstellung des Projektes und des Erstellungswegs zur S1-Leitlinie, die Erläuterung der klinischen Relevanz der Klassifikation EAES 2015, die wissenschaftliche Begründung der wichtigsten Empfehlungen und die Darstellung stadiengerechter Therapieoptionen.

Dr. med. Mihailo Andric

Springer Medizin

Abstract

Purpose

Methods

Results

Conclusions

Bitte loggen Sie sich ein, um Zugang zu diesem Inhalt zu erhalten

Weitere Artikel der Ausgabe 11/2010

γ-Catenin is an independent prognostic marker in early stage colorectal cancer

Intraoperative pelvic nerve stimulation performed under continuous electromyography of the internal anal sphincter

Should barium enema be the next step following an incomplete colonoscopy?

Comparison of short, long-term surgical outcomes and mid-term health-related quality of life after laparoscopic and open resection for colorectal cancer: a case-matched control study

An enhanced recovery programme reduces length of stay after rectal surgery

Letter to the editor on the article “Treatment of grade III and IV haemorrhoidal disease with PPH or THD. A randomized trial on postoperative complications and short-term results”

Update Chirurgie